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汇总 | 零基础从「基因功能注释」到「富集分析」

 生信药丸 2022-01-09

今日周末,距离下班还有30分钟,距离寒假还有一周。对于我们,每天早晨 8:00 到晚间 24:00,很自由也很不自由。自由是科研这个职业的原本属性,不自由是自己不愿平平消磨时光的初心。

近期事情还是不少的,或者应该说,事情永远是忙不完的。今天没啥值得写的,与最近的状态一致。想了一下,就整理一个汇总贴,方便新接触 TBtools 的朋友,可以解决自己希望解决的问题。

1. 常常我们做某个物种的数据分析时,我们希望知道几乎每一个的大体功能,那么可以参考这个推文

3min~插件 | 蛋白序列集合功能注释快速完成 - Quick Protein Anno

2. 如果是希望得到 Gene Ontology / KEGG / Pfam 等数据库的注释信息,那么可以参考这个推文

零基础完成基因功能注释/GO/KEGG/PFAM...

3. 如果你有了注释,有了某个基因集合的ID,希望看一下功能富集分析的结果,那么可以参考这两个推文,其中包括原理,也包括操作

「GO富集分析」从原理到实践 ~ 零基础掌握

点点点,KEGG Pathway 通路富集分析

4. 如果你想知道,自己关注的一些基因,都在哪个 KEGG 通路上,那么你可以看看这个推文

动态交互!KEGG Pathway 感兴趣的基因标记在通路上

总的来说,我觉得已经几乎覆盖绝大多数分析需求了,而且,几乎所有人,只要愿意花时间看看这些教程,那么都可以掌握方法,进而完成自己的数据分析。

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