【原】空间转录组分析工具速递1：stLearn

stLearn

工具官网：

• https://stlearn./en/latest/index.html

代码官网：

• https://github.com/BiomedicalMachineLearning/stLearn

简介：

开发了一种新的整合分析方法，利用三种数据类型：基因表达数据，组织形态数据和空间位置信息，首先找到细胞类型，然后重建组织内的细胞类型并推测进化路径，还可以寻找具有细胞间高相互作用的组织区域(热点区域，hotspots)

• 发表时间：May 31, 2020
• 发表杂志：bioRxiv preprint
• 文献Doi ：https:///10.1101/2020.05.31.125658

发表作者：Quan Nguyen 昆士兰大学分子生物科学研究所