流式图最常用的是:直方图、散点图、等高线图。
1. 直方图(一个通道的信息) 流式直方图形成的原理与统计学中的直方图相似,是在统计学直方图的基础上进一步发展而成的。流式直方图的x轴表示一个通道的值,y轴表示细胞数量。 流式直方图虽不是如此简单,但是基本原理是相同的。流式直方图是在此统计直方图的基础上,使统计区间不断地缩小,缩小到甚至可以认为一个值就是一个统计区间,使统计的细胞数量不断地增加,增加到以万计,甚至以十万计时,相邻的小统计区间内的细胞数相差不多,这时的直方图好像是由光滑的曲线所围成的。 2. 流式散点图(同时显示2个通道的信息) x轴表示一个通道的值,y轴表示另一个通道的值,图中每一点代表一个细胞。 与流式直方图相比,流式散点图能够同时表示两个通道的值,能够更加直观地表示细胞的信息,所以流式散点图更加直观和常用。更易于细胞分群、分类,以及确定比例关系等。
一般在流式分析过程中,先利用FSC-SC物理图根据细胞的大小和顆粒度将细胞进行分群,然后根据目标细胞处于哪个群体,再将该群体细胞设门(set gate),进一步分析该群体中的目标细胞。 门(gate)是流式分析过程中一个较为重要的概念,流式分析时有时不希望所有的样品细胞都显示于流式图中,而是希望只显示感兴趣的细胞,排除其他非相关细胞的干扰,使显示的信息更加直观,更具有针对性。 流式细胞术散点图参数FSC-A与FSC-H中的A是area的缩写,H是height的缩写。这是机器在记录信号时所采用的参数(不显示在用户界面,在调试机器的时候可以显示)。每个细胞通过激光的时候,机器都会记录一个波状信号(一个拱形的信号),H就是这个拱的高度(代表的是信号的强度),A就是这个拱的曲线下面积,代表信号强度和细胞大小的关系。其实还应该有一个参数W,是width的缩写,是这个拱的宽度,代表细胞通过激光束所花的时间。散点图通常用于显示和比较数值。例如科学数据、统计数据和工程数据。当要在不考虑时间的情况下比较大量数据点时,请使用散点图。散点图中包含的数据越多,比较的效果就越好。气泡图要求每个数据点具有两个值(探顶值和探底值)。对于处理值的分布和数据点的分簇,散点图都很理想。如果数据集中包含非常多的点(例如,几千个点),那么散点图便是最佳图表类型。在点状图中显示多个序列看上去非常混乱,这种情况下,应避免使用点状图,而应考虑使用折线图。 3. 流式等高线图(同时显示2个通道的信息) 流式等高线图与流式散点图相似,一张流式等高线图也能同时显示两个通道的信息,所不同的是,它借助地理等高线图的形式。地理等高线图用封闭的环线代表海拔高度相同的地方,环线聚集越多,表示海拔高度变化越快,环线的中央区域表示海拔最高或者最低的区域。 流式等高线图借助地理等高线图表示细胞的密集程度,流式等高线图的环线代表的是细胞密度相同的区域,所以,环线聚集越多的地方表示此区域细胞密度变化越快,细胞最稀疏的地方还是用散点表示,环线的中央区域代表细胞聚集的中心。 流式等高线图的意义和实际应用与流式散点图较为相似,可以看作是流式散点图的一个变体。相比之下,流式散点图更为直观,所以应用也更为广泛。 当然,流式等高线图也有其自身的优点,它较能直观地体现细胞群的集中点,等密度环线的中央区域代表一个细胞群的集中点,一般代表一个细胞群,所以在某些情况下,流式等高线图比流式散点图更能直观地体现细胞的分群。 下图显示的是正常C57小鼠脾脏淋巴细胞分群的流式等高线图。 |
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