Blast是生物信息最最经典的工具了~ 之前也和大家多次分享关于NCBI或者blast的内容 NCBI的blast虽然好,可是在线版总是有各种各样的限制,真正的生物信息分析大多还是使用服务器的命令行版本使用。可是,也不是所有人都会使用服务器。 那么,除了在线版 和 Linux服务器版,是否还有第三种选择吗? 有的,现在我们也可以用自己的办公电脑Windows系统玩转Blast了呢~~ 具体怎么做呢? 首先,让我们下载windows版本的blast安装包。 链接如下: https://ftp.ncbi.nlm./blast/executables/blast+/LATEST/ 链接中有非常多的压缩包,我们只需要下载红色框标注的那个~ 注意!是win64.exe结尾的那个文件哦~ 下载后,双击打开 出现的界面,和常见的安装软件并无区别,我们只需要一路“I Agree”和“Yes”下去就好~ 安装完成后,打开Windows Powershell工具(Windows Power Shell_百度百科 (baidu.com)) 在出现的命令行界面中,敲入blastn 或者 makeblastdb运行blast即可。 makeblastdb:blast建库命令 BLAST+中makeblastdb参数详解_likelet的博客-CSDN博客_makeblastdb blastn:blast中核苷酸比对的命令 blastn的用法 - 简书 (jianshu.com) 先建库(makeblastdb),后比对(blastn) 大功告成~ 现在,我们可以自由的用我们的笔记本电脑开始blast分析之旅啦~ 当然,还有点小遗憾,如果可以有图形化界面,支持鼠标点点的方式在windows系统操作就更好啦 关于这点,笔者目前还没有找到比较合适的工具。有好的资源,也欢迎大家随时分享啊 每一天获得一点微小的收获和进步。小确幸的科研也很好。与君共勉! |
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