分享

【罗工秘籍40】

 十六_ 2022-05-22 发布于美国

文接【罗工流式秘籍30】

Flowjo自带的周期分析模块功能十分强大,但落实到具体我们的使用中呢,经常会遇到各种各样的小问题,今天我们就举几个例子:

问题1. 我的数据为啥识别不出模型,得不到图像呢?

首先,当你在周期分析中遇到这个报错图的时候,不用紧张;
出现这种情况,就是我们在使用Flowjo中周期拟合的功能前,设置流式图的圈门时,PI轴选择不当导致的问题;如果选择的显示的形式是Log而不是Linear,大概率会出现这种识别不出,并无法导入计算模型而报错;
 
那么,我们只要上机收样的时候,确保收了Linear的形式,并把图像PI轴切换为Lin的显示就可以了;

问题2:我拟合后的数据G1、G2、S期的数据加在一起超过/不足 100%,我这个数据还能用么?
 
首先,这种情况这是模型拟合的正常现象是不会有问题的。
然后我们可以通过一些优化的操作,来让我们的数据,最终合计的数值尽可能的贴近100%;具体有可以分两步,做好笔记喔:
①    分析周期的数据时,我们都知道有很多的黏连体的干扰,那我们通过调整分析前的圈门策略,通过去黏连的操作,和尽量排除掉细胞的碎片,来让我们的数据数值更加精准;
②    Flowjo软件是通过不同的计算模型来呈现最后的图像,那我们自然也可以通过更改选择不同的拟合公式,来得到不同的计算模型图像。
           
Flowjo的模型选择中就提供了3种不同的拟合计算方式,我们可以通过不同计算公式的切换去得到一个更小的RMS值(Root Mean Square 均方根值),即得到一个更好的拟合效果;随着计算模型公式的变动,我们周期数据中每个细胞期的百分比值和CV值也会随着更改;

问题3:我的数据只识别出了峰值,S期识别不明显怎么办?/我的数据明明有峰值,却没有自动识别出来怎么办?
 
遇上这些问题时,我们首先要确保上机时电压要合适,不能太小;要让不同周期峰能够跑得比较开,也可以通过调动坐标轴让整个细胞的群体位置比较合适,这样软件也就能更方便的自动识别出你的周期数据;
 
(不清楚如何具体调节流式图的同学去回顾第11期罗工秘籍喔)

其次,Flowjo除了自动识别峰,也有手动圈峰值范围的功能,当你的数据无法正常自动识别出峰时,也可以尝试这个手动圈定的功能。
 
好了,本期周期数据分析的解惑就到这啦;更多数据分析技巧会持续更新,大家要保持关注呀。

    本站是提供个人知识管理的网络存储空间,所有内容均由用户发布,不代表本站观点。请注意甄别内容中的联系方式、诱导购买等信息,谨防诈骗。如发现有害或侵权内容,请点击一键举报。
    转藏 分享 献花(0

    0条评论

    发表

    请遵守用户 评论公约

    类似文章 更多