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依然是上篇帖子的《Cell》文章图表,虽然很简单,但有个图有点意思。这个图还是气泡图类型的,但是特点是用不同的形状将分组表示出来了,我们以往的图中没有涉及这一点,这里做一下。 
(Reference:Proteogenomic characterization of pancreatic ductal adenocarcinoma) 数据是我虚构的,作图数据包含的要素有:两两对应关系和分组。ggplot可轻松实现,当然还可以在我的基础上继续美化。
setwd("F:/生物信息学") A<- read.csv("A.csv",header = T) A$Pvalue.adjusted <- -log10(A$Pvalue.adjusted) library(ggplot2) ggplot(A,aes(Phosphopeptide,CNV, shape=group, size=Pvalue.adjusted))+ geom_point(aes(fill=Spearman), color='black')+ scale_shape_manual(values = c(22,21))+ scale_fill_gradient2(low='navy',high='firebrick3', mid="white")+ theme_bw()+ theme(axis.text =element_text(size = 10, color = "black"), axis.text.y = element_text(face="italic"), axis.text.x=element_text(angle=90, hjust = 1))

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