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复现《Cell》图表:多形状气泡图

 TS的美梦 2022-05-25 发布于重庆

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依然是上篇帖子的《Cell》文章图表,虽然很简单,但有个图有点意思。这个图还是气泡图类型的,但是特点是用不同的形状将分组表示出来了,我们以往的图中没有涉及这一点,这里做一下。

(Reference:Proteogenomic characterization of pancreatic ductal adenocarcinoma)

数据是我虚构的,作图数据包含的要素有:两两对应关系和分组。ggplot可轻松实现,当然还可以在我的基础上继续美化。

setwd("F:/生物信息学")A<- read.csv("A.csv",header = T)A$Pvalue.adjusted <- -log10(A$Pvalue.adjusted)library(ggplot2)ggplot(A,aes(Phosphopeptide,CNV,              shape=group,              size=Pvalue.adjusted))+  geom_point(aes(fill=Spearman), color='black')+  scale_shape_manual(values = c(22,21))+  scale_fill_gradient2(low='navy',high='firebrick3', mid="white")+  theme_bw()+  theme(axis.text =element_text(size = 10, color = "black"),        axis.text.y = element_text(face="italic"),        axis.text.x=element_text(angle=90, hjust = 1))

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