Embryonic Stem Cells Exhibit mRNA Isoform Specific Translational Regulation.
|核心内容: 许多mRNA的多种变体的存在是蛋白质多样性的主要贡献因素。这些变体的加工是以细胞类型特定的方式严格控制的,并对基因表达控制有重大影响。在这里,我们研究了胚胎干细胞(ESCs)和胚胎干细胞来源的神经前体细胞(NPC)中单个mRNA变体的差异翻译率,方法是将多聚体分析与RNA测序相结合。我们发现,在ESCs和NPC中有相当数量的可检测到的mRNA变体,并且其中许多都表现出不同的特异性翻译率。这与变异体UTR的差异有关,其中5'UTR起主导作用。不同的5'UTR有不同的RBP来协助参与调控该message RNA的翻译。不同的RBP复合物的翻译效率可能不同。我们认为,包含替代UTR的mRNA变体受到不同的转录后调控。这可能是由于调节翻译速率的miRNA和蛋白质结合位点(resemble enhancer in DNA?)的存在或不存在。这突出了当使用mRNA水平作为蛋白质丰度读数时解决翻译速率的重要性。进一步的分析表明,在ESCs和NPC的多聚体部分上存在许多带注释的非编码mRNAs。我们认为,将多聚体分离与RNA测序相结合是分析细胞内多种不同RNA翻译状态的一种有用的方法。Fig 1. Polysome profiling of ESCs and NPCs
参考文献:https://storage./plos-corpus-prod/10.1371/journal.pone.0143235/1/pone.0143235.pdf?X-Goog-Algorithm=GOOG4-RSA-SHA256&X-Goog-Credential=wombat-sa%40plos-prod.iam.gserviceaccount.com%2F20201220%2Fauto%2Fstorage%2Fgoog4_request&X-Goog-Date=20201220T081250Z&X-Goog-Expires=3600&X-Goog-SignedHeaders=host&X-Goog-Signature=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