大家好,我是王琪琳,是一麦众承第8小组的成员。本小组组长为郑军老师,成员有王保通老师、曹彦龙老师、程星老师、刘丙新老师、郝晨阳老师、丁凯老师、张立东老师、姚有华老师、徐四有老师。非常荣幸能在这样一个平台上与大家认识交流。在这里非常感谢陈红敏老师的辛勤付出。今天主要介绍这几年使用的一个田间记载小软件,与各位老师一同交流。
说到记载本,里面的内容各位育种老师估计都不一样,各种密码估计也不尽相同。各个著名育种家老师的记载本如同一本历史,记载了育种系统来龙去脉,也记载了育种过程中的辛酸与喜悦。但是随着育种逐步向4.0时代发展,伴随着计算生物学的不断发展,各种育种材料的基因型、转录组、代谢组、育种规模的不断扩大,快速记录和分析各种田间及考种数据包括图像数据成了大家迫切的需求。随着智能手机技术的快速更新,其存储能力、图像处理能力也越来越强。通过手机端的app进行田间表现的记载与整理可以高效的解决上述问题。
现在市面上有很多育种软件,如百奥云旗下的“百奥e采”,华智水稻推广的“育种管家”,国家农业信息化工程技术中心推出的“金种子育种云平台”,还有国外的“Genovix”等。这些软件基本版本都具备性状录入、种质管理等基本功能。目前不少育种单位也采用了部分育种软件,育种软件正在被大家认识和接受。在这里介绍一款由美国堪萨斯州立大学大学开发的免费安卓版的田间性状管理软件“Fieldbook”,其官方中文名为“田间记录本”。这里对其使用做一简要介绍。
1安装和设置
1.1 安装
安装过程和其它app安装一致,有的手机可能会提示安全信息,选择通过即可
1.2 系统界面
安装后手机界面显示图标如下:
主要展示了“地块”、“性状”、“收集”、“导出”、“设置”和“关于”6项内容
2、功能介绍
2.1 建立地块信息 ![图片](http://image109.360doc.com/DownloadImg/2022/07/0923/248281931_1_20220709110934269.jpeg)
![图片](http://image109.360doc.com/DownloadImg/2022/07/0923/248281931_4_20220709110934488.jpeg) ![图片](http://image109.360doc.com/DownloadImg/2022/07/0923/248281931_5_20220709110934535.jpeg) 我们开始记载前要建立地块信息,即某一地块种植哪些材料。点开地块按钮后,点击右上角的“ ”号,即可添加地块信息文件。根据地块信息文件存放的位置选择即可。这里需要注意的是地块信息文件的类型为符合UTF-8编码的csv文件,否则中文字符在软件中就会显示为乱码。地块信息文件就相当于我们纸质记载本的表头部分,必须包含唯一编号列(例如行号,要求这列数据不能有重复值出现)、田间位置信息列(比如种在第几排)、材料名称、系谱等(如下图)。 完成以上工作后地块信息建立完毕。
2.2 建立性状信息
点击性状按钮后进入性状信息界面,可看到系统默认的性状类型。我们可根据实际需要建立性状信息。根据软件设定,我们常见的性状信息主要有以下几类:
日期型:比如出苗期、返青期、抽穗期、扬花期、成熟期等需要以日期作为记载内容的性状。
数值型:这类性状包括株高、苗数、株数、穗数等以数值作为记载内容的性状。
文本型:文字评价等
图片型:某个材料某阶段的田间照片
对需要记录的性状在名称前打上√即可,也可以通过拖动来调整性状的前后顺序。
2.3 性状收集
通过以上两步就相当于完成了记载本的设计,接下来就要进行性状的收集了。点击收集按钮我们可以看到收集界面,通过对性状的切换即可完成性状收集。性状行的左右箭头可切换性状,导航行的左右箭头可切换唯一标识号(如行号)。通过性状的来回切换、录入,就可以完成某一材料田间性状的记载。
2.4 数据导出
点击导出按钮即可进入数据导出界面,导出的格式可以选择数据库和表格两种格式类型。需要导出的数据也可以根据当前的需要选择。导出的数据文件以导出时间 地块信息来命名,方便数据的积累和整理。 ![图片](http://pubimage.360doc.com/wz/default.gif)
3 数据的整理,导出的数据 通过手机数据线和电脑连接,进入到手机文件系统,找到Fieldbook文件夹,该文件夹结构如下图
Field_export就是导出数据所在的文件夹,存放着导出的表格文件、数据库文件等。根据需要复制相应的文件打开进行分析
![图片](http://pubimage.360doc.com/wz/default.gif)
Plot_data文件夹中存储就是图片、音频类型的性状信息。
这些图片的命名方式为:唯一标识号 性状名称 顺序号 拍摄时间,这种命名方式对我们整理图片信息带来非常大的方便,只需要搜索性状名称就可以找到对应的照片。而不用再把每张照片打开一张张看过去,能够节省大量的时间和精力。
以上就是Fieldbook简要的使用介绍,这个软件小巧使用方便对网络基本没有要求,所有信息都储存在手机上,在田间网络环境不好的情况下也不影响正常使用。目前该软件的版本已经更新到5.07,稳定性进一步增强。但受限于众所周知的原因,我们不能通过谷歌应用商店正常下载本软件。如有感兴趣的老师可尝试下载或者和我联系。 作者简介:王琪琳,男,2017年毕业于西北农林科技大学植物病理学专业。研究生期间一直从事小麦抗条锈病遗传研究。2020年起加入陕西九丰农业科技有限公司,目前主要从事小麦功能性育种及加工研究。
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