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婴儿肠道微生物的组成与生活方式有关

 风湿中心 2022-08-04 发布于上海

从出生开始,人类肠道微生物组就经历了复杂的组装过程,最终成年微生物组组成可能取决于生命早期获得的菌种。对于生活在工业化国家的婴儿来说,经过一系列步骤,最终成年后的肠道菌群多样性低。然而,采用非工业化生活方式的成年人通常具有更多样的微生物组。

工业化国家的婴儿微生物组已得到深入研究,但是对非工业化国家的婴儿,这一过程研究较少。美国斯坦福大学医学院的Matthew R. Olm等开展的研究揭示了不同生活方式下婴儿肠道微生物组形成的显著差异。

研究人员对坦桑尼亚哈德扎(Hadza)狩猎-采集社会的婴儿粪便样本进行了深度宏基因组测序,并在全球荟萃分析中进行了分析。哈德扎人是一群生活在撒哈拉以南非洲的现代狩猎-采集者。哈德扎人居住在约由5~30人组成的半农耕灌木丛营地中,生活在这里的婴儿早期由母乳喂养,2~3岁时断奶并开始食用猴面包粉和预先咀嚼的肉。

图1 年龄和生活方式与微生物组组成有关
(A) 基于扩增子序列变异丰度,对18个群体中1900份婴儿(<3岁)粪便样本进行未加权UniFrac不相似性主坐标分析(PCoA)(左上图)。点颜色表示不同生活方式,点大小与月龄成正比。箱线图显示了沿PCo1的指定年龄组(底部)和沿PCo2的队列(右侧)的分布。(B)三种生活方式类别(实线)和特定指示亚群体(虚线)的PCo2与样本年龄的关系。紫色虚线包括俄罗斯(卡累利阿)和南非[RU(卡累利阿)+SA],绿色虚线包括马拉维、尼日利亚(城市)和孟加拉国(MWI+NG+BD)。中间过渡线(蓝色)包含所有过渡样本。(C)按年龄组和生活方式划分的CAG相对丰度。注释中的分类群是CAG中最丰富的分类群

分析发现,婴儿微生物组沿着与生活方式相关的轨迹发展,在哈德扎婴儿肠道中检测到的基因组中超过20%都是新物种。工业化国家的婴儿,即使是母乳喂养的婴儿,其微生物组特征是缺乏双歧杆菌和与母乳利用有关的基因盒。与生活方式相关的菌群在母婴中共享,佐证了与生活方式相关的微生物在生命早期的“母婴传播”途径。

研究发现,非工业人群的肠道菌群多样性较早出现,可追溯到“母婴传播”,并受到当地环境的一定影响。然而,全球肠道菌群差异的主要驱动力似乎源于生活方式,而不是地理位置。由于婴儿微生物组组成和功能存在人群差异,因此要加强对富裕工业化国家以外人群微生物组的研究。

参考文献:Olm MR, Dahan D, Carter MM, et al. Robust variation in infant gut microbiome assembly across a spectrum of lifestyles[J]. Science,2022,376:1220-1223.

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