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mNGS临床应用及展望——呼吸危重症菁英秀第二十八期“诊断-mNGS专场”后记

 meihb 2022-08-16 发表于江苏

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2022年8月4日19:00—20:00呼吸危重症菁英秀第二十八期“诊断-mNGS专场”准时直播。参加本期菁英秀的两位讲者分别是来自福州市第一医院的徐礼裕教授和河北医科大学第二医院的于婧医师。本期点评嘉宾是河南省人民医院张晓菊教授和上海交通大学医学院附属瑞金医院周敏教授。

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福州市第一医院徐礼裕教授首先介绍科室情况,并在线分享了mNGS在呼吸道感染病原学诊断实战中的应用体会。

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福建医科大学附属福州市第一医院前身系1898年英国圣公会创办的福州柴井基督医院,是一所具有百年历史和光荣传统的公立医院,是福州市属三级甲等综合医院,同时被省政府命名为福建省福州红十字医院。

福州市第一医院呼吸与危重症医学科是福建省临床重点专科(呼吸内科)、福州市临床重点专科(呼吸内科)、福州市呼吸内镜中心、国家级住院医师规范化培训基地、福州市医学会内科学分会主委单位、福建省呼吸专科医联体中心单位、福建医科大学硕士研究生联合培养点。

科室现有医护人员35人,其中医师10人,高级职称3人,中级职称4人,福建医科大学硕士研究生导师2人,硕士5人。目前承担省自然科学基金4项,省医学创新基金3项,福州市科技局基金项目3项,福建医科大学启航基金3项;发表学术论文30余篇,SCI收录6篇。

科室目前开展的技术包括硬镜下气管肿瘤切除术、气管支架置入术等,大咯血的救治是科室特色。科室牵头成立了福州市呼吸肿瘤与介入专科联盟。

在专题汇报中,徐礼裕教授介绍了传统病原学诊断的流程及其不足,同时也提出了mNGS病原学诊断的困惑,并结合临床病例分享了mNGS在病原学诊断中的应用体会。mNGS对临床精准治疗具有指导意义,但其在临床中的应用仍需遵循一定的适应证,在危重、疑难及怀疑特殊病例中,mNGS的临床价值更大,在进行报告解读时,还应充分了解其序列数、丰度代表的意义及其机理。在充分了解患者病史和临床表现、完成体格检查、完善胸部影像学及感染指标检查等的基础上,再考虑mNGS的使用。同时注意留取合格的标本,正确解读报告。

张晓菊教授:在您讲的最后一个病例中,您是如何断定患者是细菌感染,并决定让其出院带药继续治疗?

徐礼裕教授:这例患者经历了三次住院治疗,最后一次住院时,患者WBC、PCT、CRP等均明显升高,经过积极治疗,患者炎症指标全部降至正常,白介素水平也下降,患者病情改善,整体情况很好,食欲和精神状态均较好,气喘明显改善。患者出院带药包括复方新诺明和抗生素,并告知家属病情有变化随时联系医生,由于患者感染指标都正常,再继续使用抗生素治疗,效果可能并不会理想。我们与患者随时保持联系,时刻掌握病情变化和药物治疗效果。根据我们对患者的综合判断,包括患者的精神状态、影像学、感染指标等,当时考虑是细菌性感染。患者出院后1个月来院复查,影像学较前有改善。之后1个月再次复查,胸部CT可见病灶吸收良好。目前患者的身体状况良好。

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mNGS在呼吸道感染病原学

诊断实战中的应用体会

河北医科大学第二医院于婧医师首先介绍了科室历史及建设发展情况,随后对《呼吸系统感染中宏基因组测序技术临床应用与结果解读专家共识》进行了阐述。

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河北医科大学第二医院前身为1918年1月成立的直隶公立医学专门学校附设诊所,1920年扩建为医院,1958年迁至石家庄市。2013年开设东院区,2017年开设北院区,西山院区和正定新区医院正在建设中。医院科室专业齐全,人才济济,技术力量雄厚。

呼吸与危重症医学科始建于1978年(当时为呼吸专业组),是河北省最早的呼吸病专业科室。2002年,河北省最早成立呼吸重症监护病房(RICU),2009年呼吸内科发展壮大,分别成立呼吸内科一科和呼吸内科二科,2013年成立东院区呼吸内科,2017年成立北院区呼吸内科(呼吸内三科),2017年4月3日,呼吸内科4个病区全部更名为呼吸与危重症医学科。

科室目前是国家临床重点专科、河北省强势特色学科、河北省教育厅重点学科、河北省卫健委重点学科、河北省呼吸病研究所、国家临床药物验证机构、首批专科医师规范化培训基地、国家呼吸临床研究中心呼吸专科医联体单位、中国医师协会全国首批呼吸内镜医师培训基地、河北医科大学第二临床医学院,是河北省最早的呼吸病专业硕士和博士学位授予单位。

科室认识到呼吸与危重症医学捆绑发展是大势所趋,是呼吸学科长足发展的必由之路,我科按照标准进行了自建工作,对于PCCM建设标准中的项目逐项排查,学科能力逐渐提升。

在专题汇报环节,于婧医师从呼吸系统感染临床送检适应证、呼吸系统感染送检标本类型选择、呼吸系统感染mNGS检测结果解读、现存问题及展望等方面对《呼吸系统感染中宏基因组测序技术临床应用与结果解读专家共识》进行了介绍。mNGS在临床已经广泛应用,但仍然存在一些问题,目前临床仍缺乏针对mNGS检测方式的标准,而不同的标本采集方式及手法会显著影响检测结果的可信度及临床意义。而且目前尚缺乏对mNGS的基本性能和参数的统一要求,不同检测机构的检测流程及检测性能可能存在较大的差异。此外,mNGS技术仍然具有自身的局限性,其检测结果不宜作为唯一的临床感染性疾病的诊断依据。随mNGS检测成本的不断降低,通过测试数据量的进一步加大,可以获得更为完整的优势菌的基因组覆盖度,能够获得可信度更高的检测结果。未来,在微生态与责任病原微生物的判定、宿主免疫应答与责任病原微生物的判定、宏基因组与责任病原微生物的判定方面,mNGS可能会有所作为。

周敏教授:对于mNGS的检测结果,如何判定是责任病原体还是定植?

于婧医师:目前临床的下呼吸道标本大部分送检BALF,但有些患者mNGS的检测报告与临床资料不是特别符合,对于此类患者,我们还是要关注其临床症状,同时也不能忽视传统的微生物检查,甚至有时需要重新检测。临床常会遇到患者感染非常严重,但NGS报告也并未检出太多致病菌。如果mNGS报告与临床不相符时,还要结合患者临床表现、影像学及传统微生物检测综合分析。

周敏教授:尽信书不如无书。我们不能单纯依赖mNGS的检测结果,一定要回归临床,要结合经典的病原体检测方法来综合分析判断。目前临床存在一些误区,mNGS检测出什么病原体,就认为是责任病原体,然后会针对这些病原体进行抗感染治疗,但这会导致我们对疾病的误判。所以,mNGS要密切结合临床来分析才更有价值。

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呼吸系统感染中宏基因组

测序技术临床应用与结果

解读专家共识

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本期菁英秀的两位讲者从mNGS的临床应用及其呼吸系统感染病原学检测和报告解读进行了系统介绍,使我们更加深入了解了这项技术。mNGS的临床应用给感染性疾病的诊断带来正面影响,其与传统病原学诊断方法相结合,提高了肺部感染性疾病病原学的诊断效率。mNGS的出现改变了临床实践,但其在应用中仍面临诸多问题。疾病的诊断和治疗最终都要回归到临床,正确和规范地使用先进的诊疗技术,才能为广大患者谋取最大的益处。

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在本期活动的两位讲者专题汇报结束后,依次由周敏教授、张晓菊教授及詹庆元教授揭晓了“呼吸危重症菁英秀2022年度二季度优秀讲者的前三名,他们分别是复旦大学附属华东医院朱迎钢医师(三等奖)、浙江大学医学院附属第一医院周华医师、(二等奖)、中国人民解放军总医院肖坤医师(一等奖),恭喜三位青年医师获此荣誉。

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“呼吸危重症菁英秀”项目旨在吸引并选拔一大批呼吸危重症领域的优秀中青年医师,通过菁英秀活动,他们能够与学科领域已颇有建树的专家们交流学术思想,分享关于学科发展的体会。中青年医师是未来学科发展的核心力量,在临床、科研和教学方面都非常出色,相信未来他们一定能将呼吸危重医学推向更高的发展水平。

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