《基因之河》读书笔记

生物进化的是基因，流淌的是DNA。生命的真正效用函数是DNA生存。DNA就这样存在着，只要DNA能继承下去，没有人关心在这个过程中有谁会受到伤害。“因为自然，那没心没肺、无情无智的自然，并不知晓，更不在意。”

人类在宇宙进化过程中，也只是中间的一个过程。人类的DNA继续扩展边界，会拓展到太空之旅。同时，宇宙中其他地方也可能在发生同样的进程。

想到以前读的混沌的文章，有机体可能只是一个“代码”，可以自我繁殖演化的代码。已经有代码通过自学习函数，多次数据迭代，最终机器自己学会了人类摔跤的最优姿势。以后如果真的出现超高智能的AI，能够自我复制自我学习，寻求其自身生存的最大化，那么是不是真的会出现无机体或者有机体和无机体融合新物种？

摘录内容： 

第一章 数字之河

遗传代码在所有人类研究过的动物、植物和细菌之中都是相同的。这片土地所养育的生命的确来自同一祖先。从分子角度来看，所有动物之间都有着很近的亲缘关系，甚至动物和植物之间也并不远。遗传代码是有可能进行精确计算的，因为遗传代码完全是数字化的。

基因之河是一条数字之河。

神经细胞是模拟与数字的有趣混合体。化学物质通过神经细胞不断传送，要么暂停，要么不暂停，从这个角度是数字的。信息的强度，比如声音的大小、光线的明暗，甚至还包括情绪的激烈程度都会被编码成脉冲频率。脉冲频率是模拟的。分子生物学真正的革命本质在于其走上了数字化道路。

遗传代码是由4个符号组成的四进制代码。人类遗传系统的核心就是数字化的，而地球上所有的生命都拥有同样的系统。基因是纯粹的信息，DNA通过复制世世代代沿袭下来。

只有数字遗传系统才有能力历经久远的低质时间将达尔文主义贯彻下去。1953年是双螺旋元年，这一年不仅标志着生命神秘论和反启蒙主义观点的终结，也是达尔文主义最终走向数字化的起始之年。

基因不仅仅会制作可以世世代代遗传的自身拷贝，而且实实在在地在躯体之中度过一段时光，影响了世世代代为其提供容身之所的躯体的外形和行为。

胚胎始于受精卵，单一细胞通过指数级分裂成万亿级别。细胞是如何分化成为肝脏细胞、肾脏细胞、肌肉细胞等的呢？答案就在于引导指令。卵子拥有顶部和底部，还有前部和后部，左边和右边，不同位置的化学物质浓度不一样，足以形成引导指令。

 

第二章 非洲人及其后代

人类身体的每个细胞内部都充斥着数以千计的线粒体。线粒体曾是真菌，线粒体拥有自身的DNA。线粒体的DNA不参与任何性混合，无论是与体内的主“核”DNA，还是与其他线粒体的DNA。线粒体和许多细菌一样，只通过分裂的形式实现繁殖。一个线粒体无论何时分裂成为两个子线粒体，每个子线粒体都能获得与初始线粒体完全一致的拷贝，只会偶尔出现突变。人类普通DNA文本性都会将证据打乱，将父系和母系的贡献通通混淆，而线粒体DNA美妙之处在于其岿然不动，线粒体是寻找同一物种的共同祖先生存年代的理想工具。

人类的线粒体都来源于母亲，线粒体DNA没有受到污染，但并不能免于突变，拷贝过程中发生的随机错误。

得出如下结论：

第一，一定存在一位我们可以称其为线粒体夏娃的女性。她是沿女性专属继承路线向上追溯的距今最近的所有现代人类的共同祖先。

第二，一定存在一个不知性别的人，我们可以称其为焦点祖先。她或他是沿任意路径向上追溯的所有现代人类的共同祖先。

第三，虽然线粒体夏娃和焦点祖先有可能是同一个人，但这种可能性小到微乎其微。

第四，焦点祖先更有可能是一位男性而非女性。

第五，线粒体夏娃很可能生活在距今25万年。

第六，关于线粒体夏娃生活在哪里，学界尚存在争议，但在对以事实为依据提出的各种意见进行权衡之后，我们还是偏向于非洲。

非洲夏娃的故事只不过是更为久远的宏伟生命画卷上的一个狭小的人类缩影。DNA之河从未间断，一路随着我们的祖先流传至今，而其时间跨度也不止30亿年。

第三章 循序渐进 

（这章举了很多例子证明进化，案例也都很有意思）

进化的一个关键特征就是其渐进性。进化的某些阶段也可能突然发生转折。

 

第四章 效用函数

大自然并不是残忍，只不过是无动于衷罢了。这是人类需要去领悟的难度最大的道理之一，因为我们无法承认，诸事不分好坏，没有残忍或善良，就是冷漠到底，对所有的痛苦煎熬都无动于衷，没有任何目的。

人类的大脑会为诸事赋予意义和目的，我们看到任何东西都会情不自禁地去琢磨这个东西为什么存在，其动机是什么，或其背后的目的是什么。

通过观察个体终其一生的言行，你应该能利用逆向工程的思维方式，建立起他的效用函数。你能想到的效用函数不止一个。但可以稳妥的假设，他们都在将某事最大化，因为智人是深受目的驱动的物种。

生命的真正效用函数，即在自然界中得到最大化的事物是DNA生存。

当效用函数（得到最大化的事物）是DNA的生存时，就注定生命并非以幸福为宗旨。只要DNA能继承下去，没有人关心在这个过程中有谁会受到伤害。基因不在乎痛苦，因为它毫无顾忌。自然对众生的痛苦毫无兴趣，除非痛苦会影响到DNA的生存。

如果时间资源充裕，赤裸裸的现实就会自动导致种群规模壮大，直到一切恢复到饥饿和痛苦的自然状态。

这样一个宇宙，其初衷既不邪恶，也不美好。这样的宇宙不具备任何类型的初衷。在充满盲目物理作用力和遗传复制的宇宙中，注定有些人会受到伤害，有些人会走好运，你无法从中找到规律或原因，更没有公平可言。我们所观察到的这个宇宙，仅拥有我们期望的特质，那就是毫无设计、毫无目的、毫无邪恶、毫无美好，只有盲目而无情的冷漠。正如那位不幸的诗人豪斯曼所言：

因为自然，那没心没肺、无情无智的自然，

并不知晓，更不在意。

DNA并不知晓，更不在意。DNA就这样存在着，我们的舞步，要合着它的节拍。

 

第五章 复制炸弹 

一号临界点：复制因子。穿越一号临界点就有了自然选择的基本形式。一个分子能作为另一个分子合成过程的模板，是一场爆炸的触发事件。

二号临界点：表现型临界点。复制因子的存活不仅要依靠自身的特质，而且还要凭借其他一些事物带来的因果效应，我们称之为表现型。更宽泛的来说，表现型可以被定义为影响到复制因子是否取得成功。

三号临界点：复制者临界点。

四号临界点：多细胞临界点。

五号临界点：高速信息处理临界点。

六号临界点：意识的形成。

七号临界点：语言。

八号临界点：合作技术。

九号临界点：无线电技术。

十号临界点：太空之旅。