神仙级生信肿瘤数据库使用指南，你不会还不知道吧？

相信各位小伙伴们在听过酸菜大大的生信导学课后，都知道了生信的核心乃是数据，没有数据就好比巧妇难为无米之炊~

尤其是针对分析肿瘤领域的小伙伴们，不光需要丰富的数据来支持自己的各项分析，而且还需要“独特”的数据来彰显自己分析的与众不同。

那么下面小编就给大家带来一个包含人类多个癌症细胞系（即包含基因表达数据、染色体拷贝数据和大规模平行测序数据）的神仙级数据库——CCLE数据库。

CCLE数据库支持操作者在线查询基因在肿瘤细胞系的表达和突变情况，通过对该数据库的灵活使用可以让你的生信分析从更多维度解释肿瘤中基因表达谱的变化，并且不光是数据丰富，就连其自带的可视化操作工具都可以做到，只需要鼠标简单操作即可分分钟可视化发表级图表。

那么下面就让我们进行CCLE数据库的详细解读吧~

CCLE数据库简介

CCLE数据库全称——Cancer Cell Line Encyclopedia即癌症细胞系百科全书，其数据库内包含对上千种癌细胞系的多组学图谱深度解析且于2019年进行更新后，更是新增了1000多个细胞系的遗传突变、RNA剪接DNA甲基化、组蛋白修饰等相关信息。

不光数据方面十分丰富，就连可视化方面都做得都与前者旗鼓相当，其基因表达数据能可视化为条形图、基因甲基化可以通过气泡图来可视化而且支持在不同细胞系中进行可视化分析，更为重要的是支持单个细胞系突变数据的在线查看和下载，满足你的一切生信需求，既可以当作数据的丰富来源，又可以分分钟可视化出发表级图片。是你肿瘤分析中的不二选择。

CCLE数据库页面介绍

登录CCLE数据库，点击导航栏中的“about”可以进入about页面，此页面展示的是CCLE数据库的基本数据信息，包括数据数目及种类等等。

点击导航栏“Data”可进入Data页面之后可以查看和下载所要搜索的细胞系或基因组的相关数据，这里的数据会分为三个模块（小编提示：但是必须登录网站才可以查看和下载哦~）

小编划重点~~~，如果你的分析中想做耐药实验，想对某个靶点进行药物处理，这时候你也可以使用这个数据库，只需要在某个细胞系中，查询其IC50值，即可作为药物浓度参考（药理学的小伙伴们都惊呆了~）

CCLE数据库核心功能详解（可视化）

俗话说的好“一图胜千言”，优秀的数据结果，如果没有一个优秀的可视化结果岂不是一大憾事！那么接下来就带大家大致了解一下CCLE数据库可视化步骤，详细的学习请参见解螺旋精品单元课哦~

绘制基因表达谱

在检索栏输入基因或细胞系名称，以“TP53”为例，点击“Search”，待页面刷新后，可视化结果即立刻呈现（不是吧~居然这么简单）。

敲黑板划重点啦~不光有箱线图，散点图也可以通过鼠标点点点的操作进行即时可视化哦~

这时候可能有小伙伴会问了，小编，你说这么好的数据库，为什么我在以前没有注意到呢，是不是很少有人使用啊！
面对这类的提问，小编的回答只有一个“NO~NO~NO”其实有很多文章都使用了这个数据库，只不过平时的你可能没有注意到罢了，下面这篇文章就用了CCLE数据库进行了部分可视化：

如果觉得影响因子不够高，我们这里还有更高的哦~

都看到这里了，小伙伴们还有理由不去学习这个数据丰富+分分钟可视化发表级图片+高影响因子杂志“红人”的神仙级数据库吗？