成纤维细胞生长因子相关信号异常是许多癌症的驱动因素,近年来FGFR抑制剂的研究取得很大成功,2019年首个FGFR泛抑制剂Erdafitinib被FDA批准上市,目前FGFRs抑制剂的研究则集中于实现亚型的高选择性。
通过四个亚型的序列比对发现FGFR4的GK+2位置存在非常独特的552位半胱氨酸,而其他三个亚型则为酪氨酸,同时在其他类型激酶中仅发现4个激酶的GK+2位置存在半胱氨酸(MAPKAPK2,MAPKAPK3,p70S6Kb,TTK),这为发现共价结合于C552的具有高选择性FGFR4抑制剂提供了理论基础。 本项目通过高通量的筛选发现化合物7和8存在FGFR4高抑制活性,均能共价结合于半胱胺酸残基,并且对FGFR2有超过50倍的选择性,同时对50种激酶进行筛选也表现出显著选择性,其中本项目选择化合物8作为hit进一步研究。 基于hit compound 8进行了初步的构效关系研究,将喹啉骨架改为苯并脂肪杂环,并替换共价基团醛基为氰基,末端吡啶环的R取代,其活性表明化合物16类骨架具有较好活性,可进一步优化。 进而确定醛基为共价基团、优化吡啶并哌啶骨架分子的不同取代,其中末端吡啶环优化侧链获得的化合物27和29活性显著提升。
随后评价了化合物24的成药性,发现其生物利用度仅4%,肝脏微粒体存在明显不稳定,其主要是哌啶环的羟基化及醛基的还原。 基于此,该类骨架稳定性优化成为下一步主要工作,如下图,主要通过醛基邻位及末端吡啶环的不同取代进行优化,实现了代谢稳定性的提高。 进而对较优化合物43(酶活IC50:2.9 nM,Hep3B细胞IC50:73 nM)进行成药性及体内活性评价,但是其生物利用度仍然比较低(22%),在60mg/kg的剂量口服剂量下(每日两次)才表现出较好的抑制活性。 进而对化合物43进一步结构优化以实现活性及稳定性的最优平衡,着重修饰了醛基邻位的N乙酰基取代,与Arg483构建氢键相互作用,化合物61-69酶活均显著提高。 通过优选化合物42、48、61、68的成药性评价,并选择化合物68(生物度可达25%)进行体内活性评价,其体内活性有较明显的提升,其溶解性<6 uM可能是限制其生物利用度的原因。
总结: Roblitinib在2014年被FDA批准为首个进入临床的高选择性FGFR4抑制剂,该文章详细的介绍了该项目的研究过程,该项目的立项依据非常值得研读,发现高选择性抑制剂的基础是靶点结构的特异性(C552);其次本文提供了一个标准的hit—lead—candidate的经典案例,hit—lead的过程注重活性的提升,从lead到candidate则是成药性和药效的平衡优化。 注:本文着重截取了改构优化思路,更多活性相关详情请见原文。 参考文献: [1] Robin A. Fairhurst. Discoveryof Roblitinib (FGF401) as a Reversible-Covalent Inhibitor of the KinaseActivity of Fibroblast Growth Factor Receptor 4. J. Med.Chem. 2020.DOI:10.1021/acs.jmedchem.0c01019. |
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