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GSAman | 「时光机」!人工矫正基因结构注释神器新特性~

 生信药丸 2022-10-17 发布于贵州

写在前面

那天,我问了下「冯董」一个问题:“你觉得,现在和Apollo相比,IGV-GSAman 是不是已经足够晚上?”。冯董沉默。

说实话,我觉得他不如不回复。回复了这个,「有一点差异」?那不就是一针见血,一剑封喉?其实我们都知道,撤回这个在不少时候,还是有用的。但是开发成本很高啊,要想清楚实现逻辑,还要撤回起来不要太慢.....
现在好了,不写也不写。正好也是周末,我看了看「To do list」,发现现在已经有不少功能等待添加了。但是只有这个撤回相关功能是致命问题。其他特性,早点晚点都只是锦上添花。想来想去,索性还是干了,不然后面也不时就想起来。
正如 GSAman,如果不写他,那我不时就会想起来失败的 GSAme。难受!于是,今天推出 IGV-GSAman 的新特性,名为「Time Machine」,也就是时光机。因为他比简单的说「撤回」来得有意思。

Time Machine 接口

增加了「Time Machince」,会记录从当前打开 IGV-GSAman 开始,对注释进行的所有调整。

可以看到,刚才我删除了一些转录本,调整了一些外显子位置,也做了其他一系列的操作。
使用「Time Machine」功能,可以选中具体「可能」要退回的状态对应的那一行,随后使用下述三个摁钮进行操作。
界面下方有3个摁钮,分别是:

  1. Take a Glance:点击后,可以预览退回到指定某个修改处,那么在该修改发生之前,状态如何

  2. Apply (Caution!):点击后,会退回到指定修改处,这个退回是绝对退回,一旦Apply,那么在指定修改处之前的所有修改,仍然存在,而在其之后的所有修改,则会消失(这个操作就像,你回到昨天晚上,决定不吃那一顿魔鬼辣火锅,那么你成为喷射战士这个状态就会消失!因为你到了另一个平行世界)。

  3. Cancel:取消或关闭当前 Time Machine。注意到这个主要是针对你对目前预览的撤回状态不满意,那么就不修改了呗。而如果你前面已经点了 Apply,那么窗口已经消失了,你没机会Cancel了。

Emmm,我想这个已经解释得很清楚了。总之在你 Apply 之前,可以先 Glance,看看过去的哪个状态的你是最佳状态,可以往最前面看看,往中间看看,或者往最后看看,甚至每一个瞬间,你都可以看一看。想清楚后,再Apply。
真是完美,我真是.......Emmm,有才。这个有意思。

写在最后

OK,今天的更新就这么多。我想象得到,大家也审美疲劳了。每次都这样的,TBtools 也是,卡通热图也是,这个 GSAman 也是的。如果你连着半个月就一直在说,某某功能又更新了,云云,说实话,除了写的人觉得有趣之外,看这些推文是真觉得挺无聊。当然,对于我来说,主要还是记录一下。
后来的某个时间点,你就会明白,「互联网的记忆」对你很重要。

最后,附上前几天录制的相关使用视频

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