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基因甲基化筛查到底是什么

 敬善生物 2022-11-04 发布于上海

基因(遗传因子)是产生一条多肽链或功能RNA所需的全部核苷酸序列,相信很多人都听过,但是基因甲基化是什么,估计能答上的同学就很少了,今天敬善生物来为您介绍!

DNA甲基化是一个生物过程,它会在在DNA分子中引入甲基化基团,但是甲基化并不会改变序列本身,而会改变DNA片段的活性。

在哺乳动物中,DNA甲基化对于正常发育必不可少,而且与很多生物学现象有密切联系,包括基因组印迹,X染色体失活,转座因子招募,衰老和致癌作用。

胞嘧啶甲基化是在真核生物和原核生物普遍存在的,而且甲基化的速率在物种之间有很大的差异。

最常见的是在胞嘧啶的5号碳位置,在酶和底物的作用下,引入一个甲基基团,变成了5甲基胞嘧啶(5mC),从而改变了它的活性。

CpG是胞嘧啶(CCytosine),磷酸(pphosphoric acid),鸟嘌呤(GGuanine )的缩写,也可以去掉磷酸直接叫CG。在

哺乳动物中,在基因组中富含GCCpG的序列区段,叫CpG岛(CpG islands)。

1. CpG岛与转录

在人基因组中,90%以上的CpG位点是被甲基化的,但是CpG岛甲基化程度通常很低,这种情况下,不影响蛋白结合到DNA的启动子区域来启动转录,进而使基因表达。

但是,如果这个DNACpG岛被甲基化后,蛋白不能结合DNA,进而使转录沉默,基因不表达。

通常我们也会在文章中看到下面这种图,每个棒棒糖代表一个甲基化位点,位点集中的区域就可能是CpG岛,如果在转录因子结合的地方恰好被甲基化(黑色棒棒糖),那么这个基因就废了,不会继续表达了。

人类基因组中约有25,000CpG岛,其中75%的岛长小于850bp

大约50%的CpG岛位于基因启动子区域,而另外25%的岛位于基因内,通常充当替代启动子。

在人中,大约60-70%的基因在其启动子区域中具有CpG岛。大多数CpG岛在结构上未甲基化,并富集一些染色质修饰,例如H3K4甲基化。在体细胞组织中,只有10%的CpG岛被甲基化,其中大部分位于基因间和基因内区域。

在几乎所有被分析的生物中,启动子区域的甲基化与基因表达呈负相关。转录活性基因的CpG密集启动子从未被甲基化,但是,转录沉默基因并不一定带有甲基化的启动子。

回到宫颈癌中,如果宫颈癌中的抑癌基因出现了甲基化高度甲基化现象。则表明宫颈癌中的抑癌基因无法就行正常工作,癌变就像进入无人之地一般肆意侵略。医学界的专家们,正是基于这点,才进行了宫颈癌甲基化研究,可以更早更精准的检测出宫颈癌变情况,打开了宫颈癌筛查的新世界。

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