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【R】一条命令搞定相关性图

 生信交流平台 2022-11-17 发布于上海

前面小编给大家讲解过
R计算多个向量两两之间相关性
R计算mRNA和lncRNA之间的相关性+散点图
R相关性图如何按比例显示相关系数
corrplot展示m6a甲基化基因表达相关性
R语言绘图:复杂散点图绘制
【R语言】散点图+直方图+密度曲线(二)

‍今天小编给大家安利一个R包,PerformanceAnalytics,只需要一条命令就可以绘制出很酷炫的相关性图。
#安装PerformanceAnalyticsinstall.packages("PerformanceAnalytics")
#加载PerformanceAnalytics包library(PerformanceAnalytics)#加载数据data(managers)
我们使用的数据如下

#一条命令绘制相关性图chart.Correlation(managers[,1:8], histogram=TRUE)
可以得到下面这张酷炫得相关性图

图片说明:

1、对角线为样本自身表达量分布图,histogram;

2、下三角形(对角线的左下方),给出了特征两两之间在所有样本里面表达值的散点图,红色曲线为拟合曲线;

3、上三角形(对角线的右上方),数字表示两个特征的相关性值,*表示显著程度(* p < 0.05, ** p < 0.01, *** p < 0.001)。


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