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Graphpad prism绘制柱状图-2组数据

 纽万生物科技 2022-11-25 发布于广东

软件:Graphpad prism 9

数据:以qpcrR2-△△Ct值为例(2组,每组10个生物学重复样本)

C

T

1.00

0.45

0.80

0.56

0.87

0.49

1.01

0.64

0.71

0.51

0.92

0.42

0.78

0.30

1.13

0.54

1.07

0.62

1.10

0.65

方法:

1. 打开Graphpad prism 9,选择Column

2. 复制qpcrR2-△△Ct数据,粘贴

3. 找到Graphs(图),点击以上数据对应的名称,就会出现图形了

4. 选择图形,图形有Individual valuesBox and violinMean/median & error,可以选择自己喜欢的图形,这里选择Individual values中的第二个,如下图;plot选择“mean with SEM”(均数加减标准误),SEM为标准误,与SD关系为SEM=SD/Sqrt(n),因此SEM会远小于SD,作图会更好看些

 

5. 接下来是调整图形的颜值,

1)调整命名,如删除Data1Xtitle标题,点击Y轴重新命名

2)通过change版块调整

:更换图表类型;

:调整图形的大小

:选择colors,默认选择蓝色和红色

:改变X轴和Y轴的信息

:改变柱子的外观

我们根据以上方法,按照自己喜欢的风格,得到的图形如下:

 

6. 统计学分析

1)确定统计方法

2)需要确定是否符合正态分布:

点击Analysis,选择Column analyses——选择Normality and Lognormality Tests,即正态性检验

  

3. 看正态分布检测结果,一般认为,P>0.05时,数据符合正态分布。这里有几个检测,都满足了正态分布,可以考虑用参数检验中的t检验(如果不满足,则选择非参数检验)

备注:结果列表中,当几种检验不一致时,小样本以shaprio-wilk test为准,大样本以kolmogorov-smimov test为准。

4. 点击Analysis,选择Column analyses——选择t tests(and nonparametric tests)T检验或者非参数检验

  

Paired:同一个对象处理/给药前后的差异

Unpaid:两组比较,例如对照组vs实验组

5. 查看结果,P>0.05,故满足方差齐性。(注意,如果不符合方差齐性,需要重新进行T检验,choose test选择Wech’s矫正,再重复一次分析)

6. 显著性分析结果

7. 显著性分析结果作图,prism 9以上的版本,可选择自动增加显著性分析作图Draw-Automatically add painwise comparisons,然后保存图片即可,建议保存矢量图格式,如PDF,也方便后续在AI上编辑。


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