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这19.865分的文章,是怎么研究巨噬细胞胞葬的……

 老李飞刀 2022-12-02 发布于辽宁

给你们讲完胞葬(Efferocytosis),按理说就要配一篇文献,找了一下,就用这篇19.865分的Nat Metab上的文章,来讲讲胞葬的研究吧:


这篇也是动脉粥样硬化相关的文章,之前其实也介绍过,胞葬就是由于细胞死亡或凋亡后,巨噬细胞对细胞碎片进行吞噬,引发的巨噬细胞释放伤口愈合细胞因子的过程。这篇文章标题里,表明的,就是凋亡细胞碎片中的蛋氨酸引发激活的DNMT3A,在胞葬过程中,引发下游伤口愈合细胞因子表达的过程。

首先他们做了一个骨髓来源巨噬细胞(BMDMs)与凋亡细胞(AC)共同孵育的体外模型,通过检测胞葬引发的促消退因子PGE2(PGE2的合成过程是Ptgs2编码COX2将PGH2转换为PGE2)和TGFβ,来确定胞葬。他们用抑制胞葬的方法来检测Ptgs2和TGFβ的表达情况,发现胞葬抑制后这两个基因表达明显下降,而PGE2位于TGFβ的上游:


BMDMs是小鼠骨髓来源的巨噬细胞,AC是人源的,所以检测鼠源的Ptgs2和TGFβ,不会受到AC中这两个基因表达的影响。那胞葬通过吞噬AC,是如何引发下游Ptgs2和TGFβ表达的呢?他们之前的研究表明AC中的氨基酸可能会产生影响:


而另一篇文献表示,蛋氨酸衍生的S-腺苷蛋氨酸(SAM)可以被组蛋白和DNA甲基转移酶用于改变基因转录,所以他们对SAM产生了兴趣。


就此提出假设,假设是SAM对胞葬后Ptgs2和TGFβ的表达产生了影响。他们通过抑制蛋氨酸形成SAM过程中的蛋白MAT2A,确定了SAM的形成,在胞葬过程中起了较大的作用:


SAM被DNA甲基转移酶DNMT3A用于甲基化基因调控区域,这个是否会影响Ptgs2和TGFβ的表达呢?他们在加入AC的条件下,敲除DNMT3A,Ptgs2和TGFβ的表达受到了抑制,也就是没有激活胞葬下游的细胞因子。而在敲除DNMT3A后,加入SAM,恢复了部分Ptgs2和TGFβ的表达。


也就是说DNMT3A在胞葬激活下游细胞因子的环节中,起到了关键作用。那现在这个链条就变成了蛋氨酸 → SAM → DNMT3A → Ptgs2 → COX2 → PGE2 → TGFβ 。但在DNMT3A → Ptgs2中间还少了一环,DNMT3A增加DNA甲基化,所以应该是抑制表达的,于是他们首先引入了COX2上游的p-ERK,然后联系了ERK上游的DUSP4。


通过敲减DNMT3A的验证,确定了DUSP4和ERK在这条通路中的作用,整个通路就变成了:


蛋氨酸 SAMDNMT3ADUSP4p-ERK Ptgs2 COX2PGE2TGFβ 在这里DNMT3A位于通路的中间,于是他们分析了一下体内敲除DNMT3A会抑制胞葬引起的消退作用。


而体内实验,是基于动脉粥样硬化的模型完成的,敲除了DNMT3A引起的抑制胞葬,可以通过加入TGFβ恢复:


这篇文章拉的线特别长,可以说是产生了一个较长链的假设,但是是不是能论证就是这条通路引起的作用呢?也未必,因为中间的环节太多了,论证并不是特别仔细。看懂这篇文章的话,可以在评论区回复“夏老师早”、“右叔早”、“谢谢夏老师”、“谢谢右叔”等没啥营养的话,来告诉我你们已经看懂了。好吧,有兴趣看这篇文章的话,可以自己去PubMed上下搜一下实在不行就回复“公克”(不要在评论区回复),要么就直接星球上见(当然,进不去也无所谓,当作是科研过程中的一种调剂也是不错的选择哦科研并不一定要这么无聊又尴尬……今天就给你们策到这里吧,祝你们心明眼亮
封面:https:///photos/kBpmqiaW5CY

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