眨眼间2022年已经结束，今天就让我们来盘一盘过去这一年，那些利用代谢组学技术和多组学技术发表与中药研究的相关文章。
生物合成基因的缺失和串联复制驱动了龙牙楤木中三萜的多样性
发表单位：东北林业大学
期刊：nature communications
IF：17.694
发表时间：2022.4
研究内容：在龙牙楤木愈伤组织中过表达人参PgDDS基因可恢复愈伤组织中达玛型皂苷的积累。三萜生物合成基因的串联复制事件在龙牙楤木基因组中很常见，尤其是AeCYP72As、AeCSLMs和AeUGT73s，它们是齐墩糖型皂苷和芳糖苷的剪裁酶。
检测产品：萜类代谢组
发表单位：中国林业科学研究院
期刊：nature plants
IF：17.352
发表时间：2022.3
研究内容：本研究将桫椤（Alsophila spinulosa）的基因组组装到69条假染色体上。对茎解剖和木质素生物合成的详细研究为蕨类植物茎的形成进化提供了新的线索。同时鉴定了木质部中丰富的一种酚类化合物alsophin，并为其生物合成提供了分子基础。
发表单位：宁夏农科院
期刊：BMC Plant Biology
IF：5.26
发表时间：2022.1
研究内容：在本研究中通过分析枸杞(Lycium Chinese, LC)和黑枸杞(L. ruthenicum, LR)在盐度胁迫下的转录组、代谢组和激素变化，研究了不同的潜在机制。
检测产品：植物广泛靶向代谢组、植物激素、转录组
代谢组和转录组的综合分析揭示人参红皮根综合征的颜色表达机制
发表单位：吉林大学
期刊：Industrial Crops & Products
IF：6.449
发表时间：2022.1
研究内容：在本研究中总代谢物谱显示，红皮人参与健康人参相比，主要代谢物特别是柠檬酸盐减少，而主要参与苯丙类途径的次生代谢物增加。
葛根的染色体水平基因组和多组学数据集为研究豆科植物家族及异黄酮和葛根素的生物合成途径提供了新的思路
发表单位：广西农科院
期刊：Horticulture Research
IF：7.291
发表时间：2022.2
研究内容：在本研究中利用长读单分子测序和Hi-C技术组装了一个高质量的葛根基因组，此外鉴定了6个8- C-糖基转移酶（8-C-GT）候选基因显著参与葛根素的新陈代谢。
检测产品：植物广泛靶向代谢组
发表单位：中科院版纳植物园
期刊：Microbiology Spectrum
IF：9.043
发表时间：2022.2
研究内容：根腐病植株中存在的功能性药用化合物乳糖、d -果糖、sarsasapogenin、asperulosidic acid、肉毒素、杨梅油等皂苷的含量增加，健康根际栽培的紫链霉菌XTBG45 (HJB-XTBG45)对尖孢镰刀菌(Fusarium oxysporum)和炭炭疽菌(Colletotrichum spaethianum)引起的根腐病有一定的防治作用。
检测产品：植物广泛靶向代谢组、转录组、微生物组
绞股蓝中参与皂苷生物合成的达马烯二醇-II合酶的代谢组学和转录组学分析与鉴定
发表单位：云南农业大学
期刊：Frontiers in Plant Science
IF：6.627
发表时间：2022.3
研究内容：检测到46种三萜在匍匐茎中高度富集，而基因表达分析表明，负责皂苷骨架生物合成的上游OSC基因在叶片中高度表达。这些结果表明，皂苷骨架主要通过OSCs在叶片中生物合成，随后通过CYPs和UGTs生物合成转移到匍匐体，形成各种人参皂苷和绞蓝皂苷。
检测产品：萜类代谢组、转录组
转录组和代谢组的综合分析揭示了启动子区查尔酮异构酶基因DNA甲基化对多穗石斛黄酮类化合物的影响
发表单位：华北理工大学
期刊：Synthetic and Systems Biotechnology
IF：4.692
发表时间：2022.5
研究内容：在本研究中分析了LpCHI启动子的DNA甲基化位点及其对基因表达和代谢产物积累的影响，LpCHI表达与黄酮积累呈正相关。
全长转录组和代谢组学分析揭示了三七根着色的机制
发表单位：中国中医科学院
期刊：Scientific Reports
IF：4.996
发表时间：2022.3
研究内容：在本研究中比较了普通品种和新品种在形态、转录和代谢水平上的差异。结果表明，该品种根系形成层周围的周皮、根茎和韧皮部富含紫色，而3 - O -半乳糖苷是引起紫色的主要花青素。
检测产品：植物广泛靶向代谢组、全长转录组
代谢组学研究不同大麻种子代谢特征和抗氧化活性
发表单位：中国中医科学院
期刊：Frontiers in Plant Science
IF：6.627
发表时间：2022.6
研究内容：在本研究中对7个不同用途大麻品种种子的代谢组进行了比较，证明了生物碱、类黄酮、酚酸、萜烯和游离脂肪酸是大麻籽抗氧化活性的主要成分。
检测产品：植物广泛靶向代谢组
综合转录组学和广泛靶向代谢组学分析提供对金荞麦根茎类黄酮生物合成的见解
发表单位：贵州师范大学
期刊：Frontiers in Plant Science
IF：6.627
发表时间：2022.6
研究内容：本研究采用转录组学和广泛靶向代谢组学首次对金荞麦根状茎进行分析，提出了金荞麦根状茎中黄酮类化合物的生物合成途径，包括13种代谢产物，11个基因编码9种酶，1个MYB转录因子。
检测产品：植物广泛靶向代谢组、转录组
发表单位：中国中医科学院
期刊：metabolites
IF：5.581
发表时间：2022.8
研究内容：本研究共鉴定出648种代谢物，并通过主成分分析(PCA)对不同产地的白藜芦醇酚类化合物进行了清晰的分离。结果表明，不同产地桑白皮的药用差异可以通过酚类化合物和类黄酮化合物丰度的变化来阐明。
苦荞驯化过程中种子代谢组的重组
发表单位：中国农业科学院作物科学研究所
期刊：Plant Biotechnology Journal
IF：13.263
发表时间：2022.9
研究内容：作物驯化往往导致遗传多样性的缩小。然而，人类的选择主要集中在可见的性状上，如产量和植物形态，大多数代谢变化是肉眼看不到的。荞麦积累了丰富的生物活性物质，是一种具有良好营养和药用价值的两用作物。因此，研究在驯化过程中这些看不见的代谢物的连接是非常重要的。
转录组学和代谢分析揭示了与木兰花间作增加湖北贝母甾体生物碱的潜在机制
发表单位：湖北省农科院
期刊：Frontiers in Plant Science
IF：6.627
发表时间：2022.10
研究内容：对在单作和间作系统中生长的湖北贝母鳞茎进行了转录组学和代谢组学的比较分析。共鉴定出40种生物碱，其中甾体生物碱26种，蜂花烷4种，酚胺3种，吡啶生物碱1种，其他生物碱6种。
