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十二原穴各有其所属经脉和脏腑，主要是五脏六腑禀受水谷气味、精微经气，转输注人于皮肤肌肉、溪谷关节、营养周身，原穴又是其气集中的地方。
因此，十二原穴是脏腑经络外在表现明显的穴位，对疾病的诊断和治疗，都有着重要的作用
正如《灵枢·九针十二原》所载：“五脏有六腑，六腑有十二原，十二原出于四关，四关主治五脏，五脏有疾，当取十二原，十二原者，五脏之所以禀三百六十五节气味也。”
十二经脉各有一个原穴，均分布在四肢腕踝关节附近。原穴在临床上，可以治疗各自所属脏腑病证，也可以根据原穴的反应变化，推断脏腑功能的盛衰。
正如《灵枢·九针十二原》所说：“五脏有疾也，应出十二原，而原各有所出，明知其原，睹其应，而知五脏之害矣。”
这些内容充分说明原穴在针灸临床既可用来诊断疾病，又可用来治疗疾病，是非常之常用腧穴。
所以，作者明确指出：“十二经络十二原，是为枢要。”
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