慈云阁座北面南，从外表看上去是个歇山式方形无平坐的两层的楼阁建筑，分上下两层屋檐，上层屋檐略有内收，但是实际上它内部没有楼层只是单层建筑，阁内当年存有一身高大的大悲佛塑像，顶天立地甚是威武雄壮，可是现今没有啦，使得内部显得空荡荡宽阔而高深。下面檐下围墙，显得特别的厚，约有1.5米左右，前后有门。
慈云阁柱网平面图（图片来自网络）
慈云阁侧立面剖面图（图片来自网络）
阁内柱网结构。从平面图中可看到，此阁分为内外两圈落地柱，外圈柱主要是支撑下檐结构，内圈柱支撑上檐和主体结构，内外柱身间有一定的距离，但是距离很近，只有16厘米。内外柱各司其职并且通过铺作斗拱绞插在一起，下面厚厚的墙体将两圈柱身牢牢地包裹起来，显得十分的结实牢固。这实际上是对楼阁起到了一种加固作用，看似简单的形式，却体现出设计者的聪明才智。一般造阁楼使用插柱造较多，但此种做法比较特殊，这种方式比起《营造法式》中插柱造和缠柱造来讲更加实用可靠，解决了上下层柱网垂直内收中错位的不稳定因素，缺点是多用了一圈柱材。实际上我们把慈云阁拓扑拆解一下就更好理解了。此阁主体建筑实际上是只具有上檐的方形结构，而下檐只相当于一个非常窄小的副阶周扎，如果将副阶的下檐去掉并不会影响建筑的主体结构。结构上讲虽是这样，但是这个“副阶”的作用也是不可或缺的。其一，慈云阁实际上应该算是内一外二的仿楼阁式单层建筑，如果没有这个下檐，它就不算是完整的仿楼阁，外观上也不会这么大气漂亮，下檐的增加使得其建筑规格提升，而且华丽美观。其二，这也起到了对内槽的加固作用，一举两得。慈云阁此种用柱方式虽然很特别，但是之前其它地方也有类似的做法，此种做法就是永定柱做法。比如在正定隆兴寺内的北宋木构慈氏阁也是使用了两圈柱网，只是两圈柱身是紧紧地贴在一起的，而慈云阁两圈柱网之间有16厘米的空隙。此钟两柱并存的方法，也充分显示出古代劳动人民的奇巧灵活的设计理念。
