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04月 | 推文精选,生生不息,奋斗不止~

 生信药丸 2023-05-01 发布于贵州

主题:交稿费

    交04月份的「稿费」,见文末

2023年04月,浑浑噩噩,一个月就这么过去了。可能,我和大伙一样,需要简单整理一下,才知道过去的一个月都做了什么。索性直接开始4月份的论文精选。

04月推文精选

04月02日,大半天翻了一本书,感觉还不错。浙江大学陈铭教授主编生物信息学教材。我认为应该是非常适合农学出生的朋友了解生物信息。《今天,我刷了一本生物信息入门书籍的前五章》。文中也放了购书链接,感兴趣的朋友可以看看。

04月03日,投递了强华师弟投稿的一个新插件,方便大范围快速搜索 TBtools 教程资料《用户插件 | TBtools 全网教程~快速检索》。这个插件还不错,主要原因是他搜索了目前最全的 TBtools 教程公开资料。

04月07日,写了一个随笔,主要记录上半年的日常感受。随笔 | 你在回复「好的」「ok」「收到」的时候已经减分~。事实上,这个系列我都是在记录我身边的事情,以及我的一些观点和看法。但实际文稿动机在于提醒一些朋友,尽管他们不一定看,或者看他们看了却不知道我是写给他们的。所谓与关注公众号的大伙共勉,其实只是说说,这个往往不是我的目的。

04月08日,推送了前述 TBtools Advanced Circos 绘制比赛的所有视频教程链接,相信对大伙用 TBtools 绘制 Circos 图会有比较大的帮助。视频手把手 | 用户教你Advanced Circos 画最好看的象形图~

04月09日,朋友求助下,我简单记录并分享了一个 KOG 注释流程。流程操作简单,当然看起来也挺实用。KOG 注释简明指南

04月11日,为了得到更好的课程效果,我从去年开始全面转向docker容器(舍弃Vituralbox)。当然与此同时,我追求的是课程上的镜像也可以在其他地方直接使用。在计算集群上,往往我们需要用singularity 而非 docker。这就涉及到 docker image 转 singularity 镜像。遇到了不少问题,踩坑记录成文《踩坑 | docker 镜像转换为 singularity 容器》。我自认为这个推文对有需要的朋友都会有帮助。

04月12日,写了一个随笔,逻辑上这个《随笔 | “你都搞不清楚你的敌人在哪!”既是给一些朋友,也是给我自己,与大伙共勉。很多时候,我们应该寻求合作共赢,而不是....

04月13日,又解散了一个2000人群。目前为止,我解散过可能接近10个群,人数均在1000人以上。原因还是精力有限,也无法应对一些确实不想应对的情况,以及应付一些人,索性解散,省得烦恼。又解散2000人群了


04月17日,优化了 MACS2 插件流程,并同步写了一个使用 TBtools,从 ChIPseq 原始测序数据到Peak Calling的完全教程。Windows 下 ChIPseq 从测序数据到Peak Calling ~ TBtools 实例教程

04月18日,为了避免大伙看图文教程看不下去,我专门录制了一个 TBtools 分析 ChIPseq 数据的视频讲演。视频讲演 | ChIPseq从测序数据到 Peak Calling 和 Binding Motifs 分析

04月20日,写了一个随笔,是一本武功秘籍。随笔 | 教你四招,把你的导师「虐哭」!

04月21日,写了一个 docker 使用教程....这个教程是我写过的目前我自己最满意的教程,因为他其实非常实用,虽然简单粗暴。最简 docker 实践 | 打包生信流程的万能神器

04月26日,04月最后一个精选推文,是强华师弟的一个投稿《用户投稿 | InterProScan最强蛋白结构域注释批量版之我写了一个插件帮你搞定》。一个非常实用的插件,可以用于批量注释,逻辑上,解决了Interproscan的一个使用痛点。

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