背景介绍 今天小编为大家介绍一个肿瘤微环境相关的单细胞数据库。TISCH首次于2020年发表在NAR上，目前被引用近200余次。今年该课题组再次在NAR上发表文章TISCH2: expanded datasets and new tools for single-cell transcriptome analyses of the tumor microenvironment，更新了TISCH数据库，涵盖了3倍于TISCH1的数据，并且提供了更为丰富的分析功能。文章题目为TISCH2: expanded datasets and new tools for single-cell transcriptome analyses of the tumor microenvironment。数据库网址为http://tisch./.
数据介绍 TISCH2包括来自50种癌症类型的190个肿瘤单细胞数据集的超过600万个细胞。 数据库使用 01搜索基因在肿瘤中的表达 TISCH2提供了两个功能模块——数据集模块和基因模块。进入TISCH2的界面后，首先可以搜索我们感兴趣的基因。这里，我们搜索了明星基因TP53。Cancer type可以选择肿瘤类型或者选择泛癌，我们选择默认的乳腺癌。Cell type included in datasets可以选择关注的细胞类型，例如B细胞，CD4细胞等，也可以选择全部。Lineage for calculating correlation可以选择接下来用于计算相关性的细胞系类型。
