【原】KEGG富集分析报错No gene can be mapped

☞ KEGG富集分析又不能做了？

当时报的错是wrong 'species'

今天又有粉丝跟小编反馈，enrichKEGG又双叒不能用了，这次报的错是No gene can be mapped。检查了一下输入，确实是entriz gene id没错。

小编自己电脑上装的是4.1版本的R，重现了这个错误。根据网络上大家的反馈，貌似要装4.2以上版本的R才能够解决这个问题。小编又在4.2版本的R里面试了一下。

BiocManager::install("clusterProfiler")

然后试了一下自带的例子

library(clusterProfiler)data(geneList, package='DOSE')de <- names(geneList)[1:100]yy <- enrichKEGG(de, pvalueCutoff=0.01)head(yy)

发现除了一些警告信息意外，是可以得到结果的。

小伙伴们可以自己尝试一下。

前面小编也给大家整理过，生信交流平台上发表过的所有GO和KEGG富集分析相关的干货文章。

☞ 【推文汇总】GO和KEGG富集分析及可视化

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