问题1:无扩增产物现象:正对照有条带,而样品则无原因:1、模板:含有抑制物,含量低 原因:2、Buffer对样品不合适 对策:更换Buffer或调整浓度 原因:3、引物设计不当或者发生降解 对策:重新设计引物(避免链间二聚体和链内二级结构)或者换一管新引物 原因:4、反应条件:退火温度太高,延伸时间太短 对策:降低退火温度、延长延伸时间 问题2:非特异性扩张现象:条带与预计的大小不一致或者非特异性扩增带原因:1、引物特异性差 对策:重新设计引物或者使用巢式PCR 原因:2、模板或引物浓度过高 对策:适当降低模板或引物浓度 原因:3、酶量过多 对策:适当减少酶量 原因:4、Mg2+浓度偏高 对策:降低镁离子浓度 原因:5、退火温度偏低 对策:适当提高退火温度或使用二阶段温度法 原因:6、循环次数过多 对策:减少循环次数 问题3:拖尾现象:产物在凝胶上呈Smear状态原因:1、模板不纯 对策:纯化模板 原因:2、Buffer不合适 对策:更换Buffer 原因:3、退火温度偏低 对策:适当提高退火温度 原因:4、酶量过多 对策:适量用酶 原因:5、dNTP、Mg 2+浓度偏高 对策:适当降低dNTP和镁离子的浓度 原因:6、循环次数过多 对策:减少循环次数 问题4:假阳性现象:空白对照出现目的扩增产物原因:靶序列或扩增产物的交叉污染 对策:1.操作时应小心轻柔,防止将靶序列吸入加样枪内或溅出离心管外 2.除酶及不能耐高温的物质外,所有试剂或器材均应高压消毒。所用离心管及加样枪头等均应一次性使用 原因:引物设计不合适 对策:选择的扩增序列与非目的扩增序列有同源性,因而在进行PCR扩增时,扩增出的PCR产物为非目的性的序列。靶序列太短或引物太短,容易出现假阳性,需重新设计引物。 |
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