分享

【科研热点】分泌蛋白基因列表

 生信交流平台 2024-02-28 发布于上海

☞ m6A甲基化相关基因集

☞ RNA m5C甲基化相关基因列表
☞ 铁死亡相关基因集
☞ 铜死亡相关基因集
☞ SCI文章中经常出现的免疫相关基因集
☞ 科研新热点——血管生成相关基因
自噬相关基因集合
【科研热点】缺氧(hypoxia)相关基因
【科研热点】趋化因子/受体相关基因
☞ 失巢凋亡(Anoikis)相关基因
【科研热点】氧化应激基因
☞ 【科研热点】免疫检查点相关基因
☞ 【科研热点】双硫死亡相关基因集
☞ 内质网应激相关基因集
☞ 【科研热点】基于2030线粒体相关基因构建预后模型
☞ 【科研热点】端粒相关基因集
☞ 【科研热点】血小板相关基因集

今天小编继续给大家分享一个最近在SCI文章中频繁看到的一个基因集-分泌蛋白基因集。

从这篇文章的名字不难看出,作者研究的是免疫相关的分泌蛋白。

这篇文章中作者也用到了胞外蛋白来跟差异表达的基因取交集。

GEO数据和TCGA数据的差异表达分析,小编已经整理成了系统的线上课程
☞ 生信交流平台线上培训课程

基因集取交集绘制韦恩图,小编前面也跟大家分享过
☞ 本地零代码韦恩图,直接导出发表级pdf图片

那么如何获取分泌蛋白基因列表呢?
其实在第一篇文章的方法部分,作者已经分享了获取方法

点击这个连接就可以跳转到相应的下载页面

https://www./search/protein_class%3ASPOCTOPUS+predicted+secreted+proteins

支持各种格式下载,一般推荐下载TSV格式的文件,便于后面数据分析。一共是3947个基因。

除了这个分泌蛋白基因列表以外,这两篇文章的思(tao)路,也是很值得大家学习的,可以先尝试去复现,然后应用到自己的研究中。关于这两篇文章的分析内容,大家有什么问题,欢迎留言交流学习。


为了方便大家交流学习,共同进步,我特地创建了微信交流群

    转藏 分享 献花(0

    0条评论

    发表

    请遵守用户 评论公约

    类似文章 更多