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科室运营的结果需要科学的方法和适当的指标进行评价分析。本文主要讨论科室运营的指标体系。 科室运营分析评价方法有很多，包括数据包络分析、模糊数学法、最优指标法、聚类分析迭代法，因子分析等等，涉及大数据建模等领域，此处不展开讨论。
一、科室运营分析指标选择的原则：全面、客观、稳定实用、具有导向作用。
二、医院发展时期不同需要不同的科室运营分析指标。医院经历初创期、高速成长期、成熟期、衰退期和蜕变期，各阶段的管理侧重点不同，要分阶段进行调整指标。
比如，在初创期，医院的生存是最重要的问题，要活下去，要保证资金流。所以在这个阶段，关注科室的经济效益，提高收入是最重要的工作。对于科室的投入情况关注程度，不如科室的产出，尤其是科室的经济效益产出。
三、科室投入指标：
科室投入指标是指科室资源存量和变化的分析。
资源投入包括了人力，物力和财力。
人力投入指标是基于人力资源系统进行科室人员的结构化，层次化的分析和规划。
物力投入指标是基于固定资产系统，物流管理系统进行科室设备、物资的盘点和分析。
这些分析指标质量受到信息化水平的影响，按归口管理原则，由归口管理部门进行分析，或由归口管理部门提供数据，运营管理部门汇总分析较好。
四、科室产出指标
从社会效益和经济效益两方面选择指标。
（一）社会效益分析是指给社会提供的医疗服务的数量和质量，三级医院还包括了科研产出和人才培养。
1、社会效益分析指标包括了医疗质量与安全指标，医疗效率指标和科研教学指标。
（1）医疗质量与安全指标包括了患者满意度，病例书写，会诊管理，合理用药，临床路径，医疗安全等。
（2）医疗效率包括了人均门急诊量，人均出院量，人均手术量，平均住院日等。
2、经济效益分析
是指有货币收入的效益，包括了业务收支状况、患者费用、资源利用、发展投入方面的指标。
（1）业务收支状况指标包括：
人均业务收入
业务收支比
单位固定成本
单位业务成本
（2）患者费用指标包括：
平均住院人次费用
平均门诊人次费用
药占比
材料占比
（3）资源利用：资产收益率
（4）发展投入：固定资产增值率
以上资料通过财务管理系统，成本核算系统，HIS系统，固定资产系统获得，可以实现经济效益指标的分析。
科室运营分析的指标选择，应该根据医院的实际情况，包括发展阶段、信息化水平的高低、部门职责分工、人员配置等进行选择。一旦确定指标之后不要频繁调整，有些指标必须以年度为单位进行对比才有参考价值。
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