【原】Admixture群体结构可视化 + Group！

写在前面

前述，因项目需要，我快快写了一个基于「Admixture」软件的群体结构分析结果可视化的小功能。个中原因？那是有一个似乎已经发表的R包，实在太难用。明明简单的东西，总要搞得很复杂，似乎一切就是为了：（1）把事情搞复杂；（2）把论文发出去。我觉得完全没必要。反正用的上我就写出来，合适就分享出来，至于发表不发表，主要不是看我想不想，而是工作有需要，那写出来发表，如果没需要，就真的懒得写论文。毕竟这实在花时间。

Admixture Q matrix Viz 增加分组标签功能

回归主题，前述，TBtools 的「Admixture Qmatrix Viz」功能可以输出这样的图

说实话，确实还挺好看的。用起来也方便，于是我不时收到用户反馈，说能不能这样或者那样优化。

自然，我都说好好好，但是确实没下定决定去做哪怕一点点优化。但有一个用户朋友非常热情，他真的花了时间：

1. 写了word文档，给我描述了具体需求和预期效果

2. 提供了 demo 数据

为此，我含泪花了大概30min优化了这个功能，于是他现在支持了「对样品进行分组 Label」。其实群体一多，这些样品标签确实就会堆叠在一起，如果样品几百个，图片长度又有限制。

那么怎么做出一些分组信息：

1. 自己对样品已经有分组预期，那么就按照 样品名\t分组名 的形式准备好分组信息即可

2. 如果没有预期，那么可以按照下述的神操作来折腾。

首先，直接把上图导出为 PDF，随后复制样品名

放到 Excel 里面，增加一列分组

随后复制黏贴到输入就行了

随后点击可视化就可以了

当然，从上图可以看出，K=5 正好符合我们的预期（当然符合...因为这个“预期”我们本来就按照 K=5 来做的）。看看 K=4，可以看到标签交互出现。为什么会这样？因为他就是交互出现...我们按照 Qratio 排序，当K=4的时候，排序上会交叉。不过，似乎「Guangxi」和 「Hainan」的分组比较稳定。

写在最后

当然，估计还是要个体足够多，这个功能才会好看，或者，我可以把图片宽度缩小一下？这样是不是就好看多了？

如果你知道怎么用 TBtools 图片交互？当然也没必要了。你导出用矢量图编辑工具也挺好

附上示例数据

https://tbtools./s/9587378dabd94b