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World J Hepatol | 肝细胞癌患者中甾醇 O-酰基转移酶 1 的综合预后和免疫分析

 智汇基因 2024-05-22 发布于广东

导语

结果:

SOAT1在肝癌患者中高度表达
在TCGA-LIHC队列中,SOAT1和SOAT2在非配对样本中高表达,而只有SOAT1在配对样本中高表达(图1A和B)。单变量分析和多变量分析表明,SOAT1表达是HCC进展的独立危险因素(图1C;附表1)。还研究了包括非配对和配对样本在内的全癌症中的SOAT1表达(图1D和E)。

SOAT1表达的诊断和预后价值
为了探索SOAT1在HCC中的诊断价值,作者进行了受试者工作特征曲线分析。与癌旁组织相比,LIHC患者肿瘤样本中SOAT1表达的AUC为0.748,而与GTEx相比,LIHC患者肿瘤样本中SOAT1表达的AUC为0.676,这表明SOAT1可能是HCC侵袭的潜在诊断生物标志物(图2A和B)。

为了澄清SOAT1在HCC中的预后价值,作者进行了OS和DSS的分析。表达SOAT1较高的患者存活率较低(图2C和D)。SOAT1的表达还与年龄、性别、组织学分级、T分期和N分期有关(图3)。此外,1年、3年和5年的OS和DSS分析表明,较高的SOAT1表达与较差的预后相关(图4)。

高和低SOAT1表达组之间的DEGs
经过对LIHC中SOAT1高表达组和低表达组进行对数转换后,鉴定出了差异表达基因(DEGs)。GO富集分析、KEGG通路富集分析和GSEA显示,这些差异表达基因主要参与PI3K/AKT信号通路、IL-18信号通路、钙信号通路、分泌因子、Wnt信号通路、Jak/STAT信号通路、MAPK家族信号通路和细胞间通讯(图5)。

SOAT1表达和免疫细胞分析
与健康对照组相比,原发肿瘤患者的SOAT1蛋白表达显著增加(附图1)。为进一步分析SOAT1表达与免疫细胞的关联,作者在LIHC中进行了单样本GSEA分析,结果显示SOAT1表达与巨噬细胞、Th2细胞、T辅助细胞、CD56自然杀伤细胞和Th1细胞的丰度呈正相关,与Th17细胞、树突状细胞和细胞毒性细胞的丰度呈负相关(附图2)。
PPI网络和中心基因
为了澄清与TCGA-LIHC中的SOAT1相互作用的蛋白质,使用STRING数据库研究了综合评分大于0.4的节点。通过Cytoscape插件MCODE获得了中心基因,网络中包括两个模块(包括CYP19A1、CYP2A6、CYP1A2、CYP1A1、UGT1A10、KLK3、KRT19和CEACAM5)。这些基因可能是HCC治疗的潜在靶点(图6)。

SOAT1和中心基因对LIHC的影响
为了研究SOAT1表达在肝细胞癌(LIHC)进展中的作用,作者采用了Lasso回归和风险评分分析。SOAT1表达与生存时间以及两个中心基因CYP19A1和UGT1A10的表达密切相关(图7A和B)。为了进一步探索这两个中心基因的预后价值,作者进行了生存分析,结果显示CYP19A1和UGT1A10表达较高的患者预后较差,与SOAT1表达的预后价值一致。

总结

作者的研究结果表明,SOAT1 可能作为 HCC 治疗的新靶点,有助于新的免疫治疗和代谢治疗策略的开发。

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