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尽管文献主题是中医药 肠道菌群，但是今天的主菜却要首推“代谢组学”。做中医药的小伙伴都知道，代谢组学是研究中医药的成分的有效手段。然而，在菌群相关研究中，代谢组却有另外一个关键作用----鉴定微生物的代谢物。这为肠道菌群的机制研究提供了重要的基础。对这个不熟悉的小伙伴们，可以看看今天这篇文章。1.文章以中药单体成分为对象，相比较常规的中药复方，研究对象更加细化，有助于提高研究深度；2.文章以肠道菌群为对象，利用中药、肠道菌群这对复杂的调控关系，为机制研究提供了广阔的探讨空间。3，文章以16s测序、代谢组学为技术手段，探究了菌群代谢物、宿主体内代谢物，本文使用的均为组学测序技术，成功率高，且这两种测序成本很低，性价比极高，实验风险低，强烈推荐给大家；（ps：目前中医药相关研究受国家大力支持，菌群以及代谢物则是中药机制研究的重要方向！对分析和复现感兴趣的宝宝们快扫码联系番茄君吧！） l题目：Pulchinenoside B4 调节微生物群和代谢来改善大鼠口腔溃疡l杂志：Applied Microbiology and Biotechnology 口腔溃疡（Oral Ulcer, OU）病因复杂免疫功能异常起关键作用，同时肠道菌群失衡与多种疾病相关，但其与OU的联系仍需深入探讨。目前已发现白头翁皂苷B4具有多种药理作用，其具有治疗OU的潜力。而且其是否能通过调节菌群改善OU仍需进一步探讨
作者构建了动物OU模型，同时进行Pulchinenoside B4（B4）的治疗，在观察到OU相关表型改善的技术上，进一步通过16s测序、代谢组学测序等探究B4通过靶向肠道菌群及其代谢产物，改善OU的作用机制。
研究者建立口腔溃疡大鼠模型后，发现模型组大鼠口腔粘膜CD68表达上升，炎症严重。经过B4治疗后，CD68表达降低，表明治疗有效减轻了口腔溃疡炎症（图1）。 作者将对照组和OU模型组大鼠的血清样本进行代谢组测序，发现34种与疾病相关的化合物（图2）。而且，这些化合物主要参与甘油磷脂的生成（图3）。B4处理改变了OU模型的代谢物组成（图4）。OPLS-DA分析进一步证实了五组样本的聚集模式。药效实验也验证了B4低剂量的治疗效果。Rank-Abundance分析显示（图5），B4处理组的优势菌比例高。共有OTU分析揭示了各组肠道微生物群的显著功能差异。B4治疗能逆转模型组和对照组之间的菌群差异，使菌群组成趋近正常（图6）。Spearman相关分析揭示了差异代谢物与肠道微生物群的显著关联。比如，乳杆菌、Romboutsia菌与脂质代谢物呈正相关。鉴于中医药的机制研究较为困难，与肠道菌群的关联则显得可行性更高，基于此之上，通过代谢组学鉴定肠道菌群的代谢物，则将机制研究更往前推进了一步。因此，16s 代谢组学是中医药机制研究的一大利器。想要get更多创新性研究思路、掌握更多前沿分析方法，或者获得分析帮助的小伙伴们快扫码联系番茄君吧~ 想复现这种思路或者定制更多创新性思路吗？欢迎直接call番茄君吧！
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