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世祖顺治五年 (1648年）四月，甘州副将米剌印、丁国栋等，反请复明，率军数万南下，兵至巩昌，攻破东、西、北关城。知府高拓斯、总兵王胤久据守大城，陕西总督孟乔芳派兵夹击，追杀米剌印于永昌县水泉堡。
圣祖康熙三年 ( 1664年），陕西省右布政使司移设巩昌。康熙六年(1667年），改为巩昌布政使司，康熙七年 ( 1668年）迁兰州。
康熙六年 (1667年）四月，陇西饥民逃往成县就食，成县知县黄泳设粥厂救济。染疾者，亲为诊视给药治疗。秋禾熟后资送归陇。
是年，巩昌府设局开炉铸钱（制钱），通行各省。康熙九年铸钱局移兰州。
康熙七年 ( 1668年）设立钱局。同治九年 ( 1870年），设立官钱局。
康熙十三年 ( 1674年 ）十二月，陕西提督王辅臣响应吴三桂反清后，派遣清叛将秦州知州巴三纲攻占巩昌，使总兵陈可、郑元经等留城据守。次年闰五月，甘肃提督张勇、总兵孙思克合兵围攻巩昌城，两月乃克。（《甘宁青史略》：十四年二月，王辅臣遣秦州知州巴三纲犯巩昌，克之。总兵陈可、郑元经入城据守。闰五月提督张勇等围巩昌。六月二十五日，西安将军穆占同、总兵官孙思克抵巩昌遣投诚官陈万策、谢辉入城招谕，伪总兵陈可等率众归降。）
丰赡仓、预备仓、常平仓、社仓，《乾隆县志》有记载，年已久远。杨恩《郡守刘公实政册序》中云“次积贮，修社仓”。又顺治十年《郡伯高公德政去思碑》载有建立义仓事。康熙四十二年 ( 1703年）重建诸仓。
世宗雍正四年 ( 1726年），川陕总督岳钟琪巡边至敦煌， 见人烟稀少，遂招甘肃州、县贫民2448户移住敦煌，各县移民分八隅集中居住，均以原县名为名，道光时改县为坊。陇西移民居住中北隅，称陇西县，后称陇西坊。
乾隆《陇西县志》影印版 雍正六年 ( 1728年），知县鲁廷琰纂修 《陇西县志》，至雍正十一年( 1733年）成志，乾隆元年 ( 1736年）付梓。
仁宗嘉庆五年 ( 1800年）三月， 清军那彦成率兵到陇西截击白莲教高天升、马学礼部于渭河南岸，高率部退走岷县。
宣宗道光五年 ( 1825年) ，在仁寿山麓重建南安书院。光绪十六 年( 1890年）知府周景曾请准拨专款改建游击署为南安书院。光绪三十二年( 1907年）四月，改南安书院为南安中学堂，民国 2 年(1913年）中学堂迁天水。
文宗咸丰四年 ( 1854年 ）三月， 因连年荒旱， 民不聊生， 北乡阳坡寨一带饥民，随当地白莲教首领石王氏（农妇）准备起义，被人告发，知县周必超派巩昌营游击马成率兵于人镇压，残杀饥民200余人，石王氏当场牺牲，其余首领石元印等人押解兰州杀害。
穆宗同治二年 ( 1863年）五月，陇西回、汉民团因故发生纠纷，西乡民团团练总李耀荣约会四乡团练进城袭杀北关回民。同治三年 ( 1864年），回军攻占东、西两关，并围攻大城、北关达16次之多。同治四年 ( 1865年）八月二十一日至十月六日，回军 2 万余人围攻大城持续46日，始终未破 城，清军曹克忠自马营来援才解围。同治五年 (1866年）八月二十日午夜，回军2000 余人，侦得城中防守松懈，攻克巩昌府城。
同治十一年 ( 1872年），设立襄武书院（在今城关一小）。
德宗光绪元年 ( 1875年），提督苏家良（回族 ），承陕甘总督左宗棠允准在北关内筑堡（称苏家堡）居住。
光绪七年 ( 1881年），设厘金局， 抽收烟税。
光绪二十一年 ( 1895年），设立牛痘局，开始种牛痘，预防天花。
光绪三十一年 ( 1905年 ），巩昌府设立邮政代办分局。民国 1 年(1912年）改设为邮政局。
是年，由邑进士马如鉴、举人刘文炳等续修陇西县志。志名《续采陇西县志草》
八月，在原钟灵池旁设立襄武高等小学堂，小学堂北面设立简易师范学堂。
九月，设陇西县巡警总局。
光绪三十四年 ( 1908年）， 设立戒烟所、官膏局，各地奉令禁烟（民国11年 2 月，甘肃督军陆洪涛开放烟禁，陇西又种大烟，至 25年禁绝 ）。
宣统二年 ( 1910年），成立县商会。至民国30年 ( 1941年 ）商民以业务分类，组织同业公会。
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