袁洪愈还唯才是举，以深入细致的考察为基础，举荐了一大批清官廉吏、饱学之士。他在任福建佥事的时候，担任南平府学教谕的海瑞，经常在拜见监司、知府的时候批评巡按御史，于是受到上官嫉恨，经常说毁损海瑞的话。袁洪愈也是海瑞式的清官，对海瑞的所作所为当然十分赞赏，就在上官面前据理力争，让海瑞的考核成绩被列为“上上”等，升迁为县令。等袁洪愈担任太仆寺卿的时候，又上疏推荐海瑞，使海瑞获越级提拔。后来海瑞以直谏名闻天下。当时的文坛“后七子”领袖王世贞因得罪严嵩而得不到重用。袁洪愈担任南京吏部尚书时，力荐王世贞，称他为不世之才、经世之器，恳请让王世贞接替自己，后万历皇帝批准王世贞担任南京刑部尚书。此外，袁洪愈还举荐曹邦辅为户部尚书，陆光祖、孙鑨为吏部尚书，于慎行为吏部尚书……总共举荐了不下二十人，这些人后来都恪尽职守，勤政爱民。
袁洪愈自身居官清廉，“通籍（做官）四十余年，所居不增一椽，出入徒步”。死后，巡抚周孔教捐金葬之。万历帝得知后，赠其太子太保衔，谥“安节”，赐葬于赭墩祖坟旁。也因为家里没钱，所以当时连墓志铭都没有准备。直到几十年后，袁洪愈的玄孙袁徵才请好友、明末清初学者徐枋补写了墓志。袁洪愈生前关心国事安全，嘉靖中曾“陈边务数事”“诏俱从之”；万历间，他又“极陈屯田废壤之害”，结果“皆议行”。他又关爱苍生，心怀慈悲，据墓志铭载，他督漕河南时，“太康扶沟盗起，捕获千余人，讯坐大辟（死刑）者六百余人”。袁洪愈“恻然伤之，力请于抚按，乞会同他官详谳”，结果“惟贼首二十余人当斩，余俱散遣复为良民，一时六百人俱不死”。
