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Nature子刊丨基于全转录组测序分析构建HCC中关键RNAs相互作用ceRNA网络。miRNAs、lncRNAs靶基因及circRNAs亲本基因的功能富集分析。研究人员鉴定了3个在HCC中显著过表达的蛋白质（AKR1B10、SULT1C2和ACSL4）、ceRNA网络分析的前10个hub基因，以及3个lncRNAs（LINC01093、LINC02037和C3P1）和5个miRNAs（has-miR-1266-5p、hsa-miR-34b-3p、hsa-m... 阅157 转2 评0 公众公开 21-10-11 09:19 |
miRNA种子序列（核苷酸2至7）与mRNA的miRNA反应元件（MREs，miRNA response elements）之间的完美碱基配对可抑制mRNA翻译并介导mRNA衰减。在合成miR-16的存在下，TYRP1 mRNA水平增加了，而miR-155的存在诱导了TYRP1 mRNA的衰减。这些结果表明，尽管miR-16与TYRP1 mRNA相互作用，但是miR-16不诱导TYRP1 mRNA的衰减。miR-16是肿瘤抑制miRNA，作者... 阅258 转4 评0 公众公开 19-12-13 23:39 |
circRNA的ceRNA分子网络构建思路。ceRNA的核心理论就是基于miRNA可以靶向结合mRNA，circRNA和lncRNA等RNA分子，因此miRNA结合位点的预测也是关键的步骤，miRNA靶基因结合位点预测目前已有很多算法和数据库，主要分为两类，一类是单纯算法预测，常用的算法有targetscan，miRanda和RNAhybird等，第二类是一些数据库收集了文献报道的有实验证据的m... 阅1 转自zhangbob2... 公众公开 19-08-03 13:44 |
什么是lncRNA和miRNA，他们都来自一个大家庭：非编码RNA（non-coding RNA）。lncRNA因其存在Introns等片段组成，长度可达数千nt，这就为吸附结合大量的miRNA提供了良好的物质基础，通过竞争占有胞内大量的miRNA，像海绵一样缓冲并削减其干涉靶基因mRNA编码蛋白的能力，我们就称这样的lncRNA与mRNA互为ceRNA关系，因此可见，作为关联节点的就是m... 阅1 转自萌小芊 公众公开 19-07-25 10:57 |
TCGA数据分析ceRNA的套路。1.3. 分别对差异的miRNA靶向lncRNA, miRNA靶向gene 进行预测。1.4. 结合miRNA靶向lncRNA, gene 构建ceRNA调控网络。1.6. ceRNA网络中miRNA, Gene, lncRNA 进行生存分析。2.2.2 miRNA 靶向lncRNA的预测 2.3 ceRNA网络的构建。基于miRNA 调控lncRNA和Gene，构建ceRNA调控网络。ceRNA网络中的miRNA, Gene, lncRNA分别... 阅1 转自Omicsclass 公众公开 19-07-24 22:21 |
寻找ceRNA网络哪家强，starBase帮你忙！ceRNA是真核生物体内存在的一种具有相同miRNA反应结合元件的多个RNA分子竞争性的与miRNA结合，从而形成的一种相互调节机制。由于miRNA调控的RNA（可以是mRNA、lncRNA或者circRNA）非常的多，而一个RNA又受多个miRNA调控，这就使得ceRNA调控在细胞内非常的普遍。通过这个工具，可以搜索mRNA-mRNA的ceRNA网... 阅1 转自yjt2004us 公众公开 19-07-24 21:59 |
