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通过对来自四个独立数据库(TCGA SARC, Gene Expression Omnibus (GEO) accessions GSE21050, GSE21122 and GSE30929)的608个软组织肉瘤亚型数据进行微环境细胞群分析(MCP), 作者根据免疫微环境对软组织肉瘤进行重新分类,分别为肉瘤免疫分类(SIC)A, B, C, D, E五种:其中SIC A为免疫匮乏型,低表达免疫细胞和血管内皮细胞相关基因;由于SI...
新遗传谱系示踪技术可规避由于Cre表达的不特异性而导致的非特异性(“异位”)同源重组。该技术将Dre-rox同源重组系统与传统的Cre-loxP同源重组系统结合起来,Dre-rox在可能引起Cre异位表达的细胞中将loxP位点切除掉,从而有效地阻止了Cre-loxP的异位同源重组,增加了Cre-loxP介导的谱系示踪结果的准确性。
该技术将 Dre-rox 重组系统与传统的 Cre-loxP 重组系统结合起来,Dre-rox 介导的重组反应在可能引起 Cre 异位表达的细胞中将 Cre 重组酶的识别位点 loxP 切除掉,从而有效地阻止了 Cre-loxP 的异位重组,增加了 Cre-loxP 介导的谱系示踪结果的准确性。而传统的谱系示踪技术利用 Sox9-CreER 同时标记了胆管上皮细胞和胆管周围的一部分肝细胞,因...
重组酶编码序列上游的特定启动子或重组酶自身的结构类型直接关系到最终在什么组织、什么时间发生基因敲除。Cre-lox系统:源自于大肠杆菌噬菌体 P1 的重组酶系统,是目前最为常用的重组酶系统。Cre是重组酶,可识别34bp 长的DNA序列 loxP。诱导型重组酶系统: 除了组成型重组酶以外,将经过改造的雌激素受体的配体结合区(ER)引入到重组酶系统...
为了解决这一技术瓶颈,周斌研究组开发了一种新的谱系示踪技术,称为 DeaLT(Dual-recombinase-activated lineage tracing),该技术将 Dre-rox 同源重组系统与传统的 Cre-loxP 同源重组系统结合,Dre-rox 介导的同源重组反应在可能引起 Cre 异位表达的细胞中将 Cre 重组酶的识别位点 loxP 切除掉,有效地阻止 Cre-loxP 的异位同源重组,增加 C...
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