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| 共 15 篇文章 |
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Cytoscape软件学习（1）：简介及安装。Figure 1 Cytoscape软件制作的蛋白质互作网络图（官网展示图片）Cytoscape是一个开源的软件平台，用于图形化显示蛋白质互作网络数据并进行分析和编辑（Figure 1）。Cytoscape对非盈利性客户免费，在他的官网（http://www.cytoscape.org/download.php）上即可下载。Figure 8它不会在桌面生成程序的快捷方式... 阅678 转4 评0 公众公开 16-03-22 17:59 |
Cytoscape软件学习（1）：简介及安装。Figure 1 Cytoscape软件制作的蛋白质互作网络图（官网展示图片）Cytoscape是一个开源的软件平台，用于图形化显示蛋白质互作网络数据并进行分析和编辑（Figure 1）。Cytoscape对非盈利性客户免费，在他的官网（http://www.cytoscape.org/download.php）上即可下载。Figure 8它不会在桌面生成程序的快捷方式... 阅16388 转124 评0 公众公开 16-03-22 17:00 |
干货 | 这些软件你都不知道，还配做科研汪么？引物设计软件。还有一个文献分析软件RefViz2.1，，与EndNote结合使用，分析文献，可以省掉大把自己看自己归纳的时间。首先软件的普及性非常广，几乎是个电脑都会装有PPT（不用担心临时需要修改图片却找不到源文件处理时的软件）。照片/图片插入/复制到PPT后，导出来的时候分辨率可能会有损失，要挽... 阅179 转3 评0 公众公开 16-03-22 16:56 |
还有区别就是经费上的区别，DGE由于主要关注差异基因，自然也就比转录组测序测序快速，价格相对较低，如果样本量大，在测序分析上预算有限，主要关注差异基因，而且有参考序列，可以考虑DGE咯。②无参转录组和DGE区别：在这里，DGE同样重点关注的是差异表达基因，其差别与有参转录和有参DGE相似，但是无参DGE由于没有参考序列，所以，我们首先... 阅6060 转31 评0 公众公开 16-03-22 05:18 |
基因表达谱分析 基因表达谱分析 生信分析 技术指标 在线咨询。基因表达谱分析直接对某一物种或特定细胞在某一功能状态下产生的mRNA进行高通量测序，用来研究基因的表达差异情况。与转录组测序相比，基因表达谱测序要求的读长更短，测序通量更小，但仅可用于基因表达差异的研究。★ 技术人员经验丰富，可以根据合作伙伴要求提供实验方案、解决... 阅477 转0 评0 公众公开 16-03-22 05:13 |
基因表达谱分析 基因表达谱分析 生信分析 技术指标 在线咨询。生物信息分析流程。研究内容。1. 原始数据处理。2. 序列mapping至参考基因组(带注释）3. 分析表达差异。4. GO、KEGG pathway富集分析。5. 差异基因表达模式聚类。6. 蛋白网络构建及分析。7. 显著性GO有向无环图。8. 基因共表达网络构建。9.Ipath整合分析。 阅1104 转8 评0 公众公开 16-03-22 05:12 |
序列比对。bowtie, bowtie2, bwa, blast, SOAPaligner,MUMmer, muscle, clustalw, blat, mega.转录组分析。基因组组装。简化基因组。宏基因组16s.蛋白组分析。microRNA分析。Chip-seq分析。全基因组甲基化。重测序分析。Bwa, SOAP, bowtie(bowtie2), Samtools, GATK, bedtools.基因组注释。功能注释。重复序列注释。比较基因组学。 阅352 转5 评0 公众公开 16-03-22 02:32 |
NGS分析入门：fastq文件的处理 ← 糗世界。barcodes是在混合测序中运用到的一个区分测序样品的手段，使用不同的barcode，就可以将不同来源的样品区分出来。第四步是对fastq文件依据测序质量进行筛选。以上这些步骤都是最基础的步骤，一开始是fastq文件，最终得到的依然是fastq文件。接下来的工作，可能会用到，那就是将fastq文件转换成unique s... 阅4802 转4 评0 公众公开 16-03-22 02:27 |
阅889 转1 评0 公众公开 16-03-22 02:01 |
img src="http://ad.doubleclick.net/N285/ad/biotech.nature.com/body-ad;artid=nbt.3434;type=opcom;subjmeta=631;subjmeta=61;subjmeta=17;subjmeta=1511;subjmeta=250;subjmeta=255;subjmeta=2514;techmeta=13;techmeta=31;techmeta=44;techmeta=42;techmeta=41;techmeta=82;techmeta=1;abr=!webtv;tile=1;sz=300x250;ord=52495205192... 阅73 转2 评0 公众公开 15-12-19 12:21 |
