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各种RNA的引物序列，你是自己设计还是查询数据库？荧光定量PCR是我们检测RNA表达最常见的实验室四大技术之一，其中引物序列的设计是大家常常遇到的问题，今天我们来介绍几个常用的查询PCR引物序列的数据库。3. qPrimerDB：http://biodb.swu.edu.cn/qprimerdb/最后这个qPrimerDb收录的物种有147个，也就是说如果你做真菌、植物、鱼、昆虫、鸟等... 阅966 转15 评0 公众公开 21-03-08 10:33 |
Sense Primer:5'''''''' TCAGACTACCTCAGCCGTTCC 3''''''''Anti –sense Primer: 5'''''''' GGTGGTCCATCTTTCCCT 3'''''''' 用Oligo验证评估引物 （回复“Oligo”，可查看用oligo软件设计引物的文章）①A... 阅1 转自解螺旋 公众公开 21-03-04 22:45 |
荧光定量（qPCR）结果整理的辅助小工具。荧光定量（qPCR）早已是各个分子生物学实验室常用的简单的实验技术。10年前（我大一）到实验室时，常规的pcr都不舍得加多0.2ul的rTaq，更不提跑一个qPCR就烧掉大几百的荧光定量。针对qPCR数据的分析方法有两种，其中一种即为 2deltadelta....（具体请参考荧光定量PCR的随机手册）。小工具的使用输入数据... 阅89 转4 评0 公众公开 19-01-14 16:46 |
手把手教你设计RT-qPCR引物！引物设计不求人！但是Pubmed设计出来的引物一般不尽如人意，比如说引物之间存在极大的互补性，3’端的互补重叠，形成引物二聚体等等。点击 Primer Parameters，设置引物的退火温度（当50%的引物和互补序列表现为双链DNA分子时的温度。小编我一般设定引物的Tm值（引物的熔解温度）为50-70C，引物长度为18-30 bp。界... 阅988 转24 评0 公众公开 18-08-01 14:56 |
RT-qPCR引物设计5秒就够了！如果你问实验室的小伙伴们，怎么设计qPCR引物啊？2、引物长度一般在17-25bp之间，上下游引物不能相差太大。一共有4对引物，如果出现如Primer Pair 4一样下方有绿色标记条的，那么恭喜你！现在PrimerBank包含306,800对人和鼠的qPCR引物，而其中鼠的26,855对已经验证过！“ 有小伙伴说“不要问我为什么！我就是这么悲... 阅221 转4 评0 公众公开 18-07-24 18:25 |
PCR 实用技巧：七大方法消除引物二聚体。[图片]相信很多人一听到引物二聚体的时候都会很愤怒，因为几乎我们每个人都受到过它的折磨。它作为 PCR 的副产物，甚至有时候是主要产物充斥着我们的整个 PCR 实验过程。你在被它折磨的不行不行的时候，你有想过它为什么总是出现在你的实验结果中吗？我认为还是你对它不够了解，知己知彼。 阅68 转1 评0 公众公开 18-07-24 18:24 |
我们来看以下一份数据，4组重复实验，用RT-PCR测了gene01和gene02的表达量，HK代表house keeping gene，即参照。## T test for gene02t.test(-dd.ct[,2])## ## One Sample t-test## ## data: -dd.ct[, 2]## t = 7.5039, df = 3, p-value = 0.004904## alternative hypothesis: true mean is not equal to 0## 95 percent confidence interval... 阅63 转2 评0 公众公开 18-07-24 18:24 |
一键完成的微RNA定量PCR引物设计。尽管微RNA芯片和微RNA测序检测方法已经普遍使用，但qRT-PCR的依旧是检验的微RNA表达定量的金标准。在针对微小RNA的PCR技术中，设计其引物的理念是基于延长待测微小RNA的长度，构建出一个足够长的PCR模板，才能进一步应用PCR技术来定量分析。result_best_primer_pairs.txt文件包含了每个微小RNA最佳引物的评分... 阅65 转1 评0 公众公开 18-07-24 18:23 |
RT-qPCR引物设计5秒就够了！中介绍了一个设计RT-qPCR引物的数据库PrimerBank，相信很多童鞋因此受益，不过该数据库只收录人和小鼠的引物，连大鼠的引物的都不收录。最顶端是该引物的基本信息，primers and/or probes一栏是该引物的退火温度和序列信息，在Sequence evaluation一栏则是该引物对应该基因的每个转录本所匹配的位置信息！而最赞的是... 阅63 转1 评0 公众公开 18-07-24 18:23 |
