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[原]mRNA测序是什么？ mRNA测序是什么？真核生物mRNA测序的研究对象为特定细胞或组织在某一功能状态下转录出来的mRNA集合，通过oligo-dT磁珠捕获带polyA尾的RNA进行建库测序，也称为PolyA-Seq。可研究mRNA差异表达或检测结构变异，筛选与疾病或性状相关的分子标记；还可揭示转录组的复杂性，确定基因以及转录本结构、可变剪接、RNA编辑、带polyA尾的非编码RNA 和新转... 阅495 转3 评0 公众公开 21-09-24 13:24 |
[原]绝对定量转录组是什么？ 绝对定量转录组测序，采用主流UMI标记技术[1,2,3]，通过UMI标记每一条序列，可以消除PCR扩增偏好对定量的干扰，真实反映样本中转录本的表达丰度（图2）。在文库PCR扩增和测序过程中难免会引入错误的碱基，具有相同UMI标记的序列可以基于多序列比对来纠正PCR扩增和测序过程中引入的错误，确保获得转录本的真实序列（见图3）。 阅140 转0 评0 公众公开 21-09-10 10:04 |
[原]外泌体RNA测序技术原理 外泌体RNA测序技术原理。外泌体RNA测序背景简介。外泌体（Exosome）是由包括肿瘤细胞在内的几乎所有类型的细胞都可以产生并释放的一种微囊，其内部包裹了DNA，RNA，蛋白等物质。外泌体上述特征和生物学功能，使其成为液体活检领域的重要研究对象，其所含RNA分子如miRNA，lncRNA，circRNA等是极具应用前景的临床诊断分子标志物。外泌体RNA测序技... 阅140 转1 评0 公众公开 21-06-19 09:34 |
[原]降解组测序技术原理 降解组测序技术原理。miRNA剪切靶基因会产生二个片段，5''''''''剪切片段和3’剪切片段，其中3''''''''剪切片段，包含有自由的5’单磷酸和3''''''''polyA尾巴，可被磁珠富集，并可在RNA连接酶的作用下连接接头，连接产物经扩增可用于下游的... 阅176 转0 评0 公众公开 21-06-19 09:32 |
环状RNA（circular RNAs，circRNAs），广泛存在于人和动植物中，是一类新的隐秘未知但却功能异常强大的非编码RNA。不同于线性RNA，circRNAs呈封闭环状结构，不受RNA外切酶影响，表达更稳定，不易降解。方案多样：从circRNA发掘与表达分析，环状RNA与长链线性RNA互作分析，到ceRNA调控机制解析，由研究人员自由选择研究方案。 阅183 转1 评0 公众公开 21-06-19 09:31 |
[原]lncRNA测序技术原理 lncRNA测序技术原理。文库优化：采用核糖体去除和链特异性文库构建方案，保留了完整的lncRNA和mRNA序列，以及序列方向性。序列完整：对样本中几乎全部的lncRNA和mRNA序列进行鉴定和分析。分析严谨：系统收集lncRNA数据库用于鉴定已知lncRNA，并设置严格的筛选条件用于发现新lncRNA。关联全面：开展lncRNA与mRNA的关联分析，深入分析lncRNA调控... 阅214 转2 评0 公众公开 21-06-19 09:30 |
[原]miRNA测序技术原理 miRNA测序技术原理。小RNA测序正是对这一类重要的调控小RNA——特别是microRNA（miRNA）展开分析，利用高通量测序技术对样本中18~30nt的小RNA序列进行鉴定和分析。文库优化：针对动植物miRNA序列的不同特别，优化文库制备流程，最大程度地富集样本小RNA序列。项目经验丰富：国内最早提供小RNA测序服务的公司之一，用户已发表上百篇小RNA测序相... 阅434 转3 评0 公众公开 21-06-19 09:29 |
[原]绝对定量转录组技术原理 在文库PCR扩增和测序过程中难免会引入错误的碱基，具有相同UMI标记的序列可以基于多序列比对来纠正PCR扩增和测序过程中引入的错误，确保获得转录本的真实序列（见图3）。真实定量：采用UMI标记技术，每一条序列都被唯一标识，保留序列真重复，去除PCR扩增假重复，真实反映样本中转录本的表达丰度。真实序列：具有相同UMI标记的序列可以基于多序... 阅171 转0 评0 公众公开 21-06-19 09:27 |
[原]转录组测序技术原理 狭义的转录组默认只包含mRNA，但是广义的转录组指的是细胞或组织中所有转录产物的集合，其中包含mRNA和非编码RNA（non-coding RNA, ncRNA）。非编码RNA目前的研究多集中在具有调控功能的small RNA（以miRNA为代表），长链非编码RNA（long non-coding RNA, lncRNA）和环状RNA（circular RNA, circRNA）上，而这几类ncRNA的调控对象都和mRNA有关。 阅365 转0 评0 公众公开 21-06-19 09:23 |
