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# 通常要求序列名字行简单为好，而且一般加chr作为开头# 给第一行添加chr标签，并去掉其他多余信息# 下面的写法复杂了些，是为了避免给已经有chr信息的名字再加一次# 帮助无脑操作sed ''''''''s/^>\([^chr]\)/>chr\1/'''''''' Homo_sapiens.GRCh38.dna.primary_assemb... 阅557 转11 评0 公众公开 20-08-24 06:52 |
献给初学者，手把手教你如何快速查找基因序列信息！我们需要获取的序列信息有两类，一类是p53 CDS也就是插入片段的序列，另一部分是载体的序列。打开GenBank格式的p53序列，我们可以看到p53 mRNA长度是从1bp-2451bp，其中CDS是64bp-1245bp，同样我们可以看到CDS翻译的蛋白质序列以及对应蛋白质序列的ID，方便我们进行检索，检索完成后，通过右... 阅24739 转58 评0 公众公开 20-03-13 20:02 |
用EndNote编辑最适合投稿杂志的参考文献格式（适用所有杂志）1、参考文献格式编辑注意：同一杂志参考文献格式并不是一层不变的，杂志参考文献格式的变化从未停止过，然而 EndNote 自身对期刊参考文献格式的更新速度远不及期刊对参考文献格式要求的更新，同时，EndNote的参考文献格式也不可能包罗万象，已有的杂志期刊的参考文献格式非常有限。P... 阅9321 转35 评0 公众公开 20-03-13 20:02 |
ZipFile(''''''''new.zip'''''''',''''''''w'''''''')# 把zfile整个目录下所有内容，压缩为new.zip文件zip_file.write(''''''''zfile'''''''... 阅332 转1 评0 公众公开 20-03-07 09:29 |
这种高通量文库筛选体系称为“Pooled Screening”，就是从一群细胞和文库分子中直接筛选候选基因的方法。什么样的高通量筛选文库适合circRNA？circRNA种类多，shRNA合成费时费力且费用高，目前国内也有成品化的shRNA文库，Geneseed的SCL-1，包含11930种shRNA分子，靶向1485个circRNA和对应的1050个来源基因mRNA，且靶向来源基因mRNA的shRNA均避... 阅923 转23 评0 公众公开 20-02-28 09:26 |
【基础讲解】鼻中隔偏曲的诊疗技巧。▍来源：耳鼻咽喉小天地。为了防止我们走散，给我们加颗小星星吧。征稿，我们是认真的。你已经有 10 年耳鼻喉科经验了？你已经治好了数以万计的耳鼻喉患者？欢迎把你的临床诊断，治疗经验投给我们！一经录用，您将会收到丰厚的报酬。 阅82 转5 评0 公众公开 20-02-21 11:07 |
单变量Cox分析显示，患有MetS和未患有MetS的患者的OS存在明显差异。图3a 肿瘤与正常组织的免疫浸润情况 图3b 肿瘤和正常组织的主成分分析(PCA) 图3c 多数患者有大量巨噬细胞浸润 图3d MetS患者的基质细胞分数较高 2.5 六个lncRNA特征的识别与预后效果验证在这一部分作者通过WGCNA，发现lncRNA模块(MEgrey、MEblue、MEbrown、ME turquoise)与Met... 阅406 转15 评0 公众公开 20-02-11 12:53 |
单细胞天地2019全年推文集锦。早在2015为攻读博士学位做准备的时候就多次查询到单细胞相关技术，那个时候都是欧洲EBI和美国的broad研究所有相关课题，可惜自己没有勇气不顾一切的冲出国门，直面创新性课题的挑战。但是早在2017我就开始陆陆续续建设单细胞相关知识体系了也初具规模，目前有5个稳定的知识输出型编辑，现在分享我们2019在单细胞天... 阅621 转5 评0 公众公开 20-02-06 23:15 |
文章发表：画最好看的核型图。这个RIdeogram包在《用RIdeogram画最美的染色体 + 位点注释&表达量》一文中有介绍。首先当然是使用核型图，展示各种各样全基因组的位点或表达量信息。在后续的版本中，还有新的图可以画。然后这篇通过网络协作的文章，就在最近发表了，我作为共同通讯作者。RIdeogram: drawing SVG graphics to visualize and ... 阅230 转0 评0 公众公开 20-02-04 00:28 |
GPL13607平台的LINC01666的探针到底应该是哪个。为了方便大家对表达芯片的探针ID进行注释，我写一个精简包。也在：芯片探针ID的基因注释以前很麻烦 和 ：芯片探针序列的基因注释已经无需你自己亲自做了, 里面详细介绍了。## 如果GPL平台没有提供，就使用我的注释ids3=idmap(gpl=''''''''GPL13607''... 阅392 转1 评0 公众公开 20-02-02 12:37 |
