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R包nomogramEx可以转换成公式！R包nomogramEx可以把诺模图中的变量与得分、以及总分与生存概率之间的对应关系用我们熟知的数学公式表示出来.那么，以后就可以不用尺子量了，或者还没有使用过自己科研成果的朋友，可以做个外部验证，看一下效果。library(nomogramEx)#诺模图转换公式需要。nomogramEx(nomo=nomo, np=2, digit=9)#这里是最后一步... 阅1 转自小林子y3d... 公众公开 20-04-22 01:07 |
RT-PCR技术相关曲线解读生信草堂交流群。RT-PCR技术中主要的曲线有下面三种：1. 扩增曲线。阈值线：一般来说，前15个循环的荧光信号作为荧光本底信号，阈值的设定就是3-15个循环荧光信号标准差的10倍，在PCR扩增的指数期（如图中箭头所指）。CT值：我们常会用CT值来计算我们的相对含量，即扩增产物的荧光信号到达设定的阈值线时所经历的扩增的... 阅1 转自yjt2004us 公众公开 20-03-02 16:20 |
如何看懂文献里的那些图（2）如何看懂文献里的图，夏老师上次给大家讲了如何看懂Western，包括Co-IP等等的图（当然我知道你们肯定已经不记得了）。这种图在文献里也是很常见的。这只是单基因表达位置的标识图，用不同的荧光也能做不同基因的表达位置：在文献中，一般会采用自噬促进剂或者抑制剂，来进行驱动和抑制自噬，可以很明显地看到，加入... 阅1 转自yjt2004us 公众公开 20-03-02 16:19 |
WB 前传：你了解你的目的蛋白吗？这个从 wiki 百科第一句话我们就看到了，这是一个 G 蛋白偶联受体，肯定是一个跨膜蛋白无疑了，这也意味着这个蛋白不是那么容易做的。四、如果是跨膜蛋白，跨几次？五、蛋白的序列？从这个结果我们知道这个蛋白跨膜 7 次，在胞内有两个较大的亚基，因此我们选择裂解液至少也要用 RIPA 而不能用 NP40，否则不能... 阅1 转自yjt2004us 公众公开 20-03-02 16:16 |
利用NCBI查找基因信息。右上方有三个链接分别可以以三种不同格式显示基因序列，如果对基因只想进行一个宏观的了解，就选择Graphics格式，如果只想得到基因序列就选择FASTA格式，如果想要得到基因的详细注释信息就要选择GeneBank格式，关于GeneBank格式注释说明，可以参考GeneBank序列注释说明。 阅1 转自sailing_3... 公众公开 20-03-02 16:15 |
在设计分子克隆的引物前，先设计一对qPCR的引物热身。这期来探讨一下引物设计，由于做基因合成需要加保护碱基以及酶切位点，可能刚开始不是特别好理解，所以我们先来探讨一下普通qPCR的引物设计，这样可以让我们对引物设计先有一个大概的了解，先了解在线设计引物以及设计引物时的注意事项，然后再来探讨一下可以设计引物的软件以及blast，最后... 阅1 转自yjt2004us 公众公开 20-03-02 16:12 |
第三招教你用Graphpad软件进行统计分析。在进行至少三次独立重复实验之后，首先需要对得到的灰度值进行简单预处理，分别将p-Akt intden的数值除Akt intden的数值，计算得到p-Akt/Akt的比值。软件提供了5款图的基本类型供选择：XY图（XY graphs），柱状图（Column graphs），组合群图（Grouped graphs）, 列联表（Contingency tables）, 和生存... 阅1 转自yjt2004us 公众公开 20-03-02 16:04 |
CoIP又叫免疫共沉淀，利用抗原A与蛋白B结合，通过A的抗体（钥匙）沉淀A（锁），再利用精制的prorein A（钥匙链）预先结合到磁珠上，使之与含有抗原的溶液及抗体反应后，磁珠上的prorein A就能吸附抗原，从而获得抗原A与蛋白B的复合体，之后就可以对B进行检测，从而获得蛋白质与蛋白质相互作用的信息。也就是说，CoIP是研究蛋白与蛋白互作，CHIP... 阅1 转自墨_h 公众公开 19-10-11 09:22 |
2）在处理“滤纸-凝胶-膜-滤纸”的三明治时，使得膜和胶与对方的背后滤纸相接触导致电流不能通过膜，从而转膜无效。电转移时会产热，过热有可能造成蛋白质的降解，同时大量产热，会使凝胶膨胀，有可能在胶和膜之间产生空隙，引起转膜不均匀，所以在转膜槽中放入冰盒，在冰水混合物中进行转膜。按照如下表格配制SDS-PAGE的浓缩胶(也称堆积胶、积... 阅35 转0 评0 公众公开 17-08-24 11:52 |
它是非必需品，但据说加上可以让你的文章提升个level.在论文或课题写作中，我们会涉及到另一类图，诸如模式图，机制图，这些图的画法我们在之前的推文中，也都讲到过。再从模式图的作用来说，从我个人多年的SCI投稿经验来看，没有什么文章是不能增加模式图的，综述也能加个分类的模式图，只怕你的想象力不够。模式图是非必需品，但加上就会让你... 阅22 转0 评0 公众公开 17-08-20 12:38 |
