| 共 11 篇文章 |
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提到m6A甲基化就不得不提到大名鼎鼎的芝加哥大学教授何川，何川教授为“RNA表观遗传学”这个全新研究领域的发起人之一，发现了首个去除RNA修饰的蛋白酶，并开发了DNA表观遗传学中DNA修饰碱基5-羟甲基胞嘧啶和5-醛基胞嘧啶等的检测和测序方法，在表观遗传学研究上具有突出的贡献。2004年获得美国癌症研究青年科学家奖和凯克基金会医学研究杰出青... 阅217 转8 评0 公众公开 18-06-10 16:37 |
其次，与常规测序类似的是，单细胞测序既可以进行DNA水平的测序，也可以进行RNA水平的测序（RNA-seq），所以应用场景是非常广的。这是在疾病中通过单细胞RNA-seq（scRNA-seq）研究不同的细胞亚群的流程图。通过单细胞RNA-seq（scRNA-seq）揭示某类免疫细胞中的亚群，讲到这里不知道大家有没有联想到我们前面介绍过的一篇宋尔卫教授的Cell：中山... 阅110 转1 评0 公众公开 18-05-10 14:32 |
这篇文章中，作者的思路很取巧，首先，作者以靶蛋白NLRP3作为基础，通过miRNA预测网站进行预测，发现靶向NLRP3的hsa-miR-223-3p。接下来，作者就探究在幽门螺杆菌入侵过程中，hsa-miR-223-3p的变化，发现幽门螺杆菌入侵后，诱导hsa-miR-223-3p的产生，后者通过与NLRP3的UTR区域结合，抑制NLRP3表达进而减弱NLRP3炎症小体的活化以及炎症因子IL-1... 阅2 转自微笑如酒 公众公开 18-05-10 14:10 |
这篇文章讲述的是在机体受到外界RNA病毒入侵时，通过模式识别受体Rig活化一型干扰素，后者诱导长链非编码RNA—lnc-Lsm3b产生，lnc-Lsm3b与RNA病毒竞争性的结合Rig，导致Rig的构象发生改变而失活，因此，避免机体产生过量的一型干扰素而诱发自身免疫性疾病，维持机体的健康稳态。通过紫外交联免疫共沉淀测序发现，lnc-Lsm3b与Rig结合后改变Rig的... 阅1 转自微笑如酒 公众公开 18-05-01 10:16 |
一般研究基因套路只要是，找到研究基因，提出假设猜想该基因在肿瘤中的作用，再通过实验验证其在肿瘤细胞中的表型和机制，最后升华实验结果在体内动物模型和临床样本上验证该基因在肿瘤中的功能作用，从而使我们的结果更具有治疗指导意义。或将基因在肿瘤建立好的模型小鼠动物体内导入，敲除，观察对体内肿瘤生长的影响，并进一步分析该基因相... 阅3 转自yjt2004us 公众公开 18-05-01 09:25 |
最近我沉迷于CRISPR的海洋无法自拔，因为别人家的CRISPR为何总能发高分，而我们却只能用来做个基因敲除，灌水呢？CRISPR的基本作用除了基因敲入、基因敲除（Knockin、Knockout）外，还有基因干扰、基因激活、CRISPR高通量筛选（CRISPR/i、CRISPR/a、Screen）等，其在临床疾病上的科研应用非常广泛。TUBB8基因在卵子成熟障碍患者群体中的遗传变... 阅2 转自微笑如酒 公众公开 18-04-27 16:16 |
转录调控涉及到的生物学过程非常广泛，从甲基化到泛素化，从可变剪切到DNA修复，从免疫反应到自噬，都能和转录调控扯上关系。1、NF-kB在免疫系统中的调节作用Regulation and function of NF-kappaB transcription factors in the immune system. (DOI:10.1146/annurev.immunol.021908.132641)当转录起始因子遇上DNA修复~TFIIH: when transcript... 阅35 转0 评0 公众公开 18-04-27 15:58 |
1. 非编码RNA：circRNA/lncRNA和miRNA，其中circRNA/lncRNA与miRNA以及mRNA的调控关系时，我们选取大家最为熟悉的ceRNA调控关系：circRNA/lncRNA通过吸附miRNA调控mRNA表达（mRNA则又可以翻译成蛋白）。1.5 模式五（反馈回路） ：miRNA——转录因子——lncRNA——miRNA.2.3 模式九及其它：这里的靶基因也可以是ncRNA，比如miRNA和lncRNA，因此... 阅29 转0 评0 公众公开 18-04-27 15:47 |
老树开新花——相同的现象如何研究出新的内容？Nature的这篇文章的机制是衣康酸盐促使KEAP1发生烷基化活化抑炎因子Nrf2来抑制IL-1β产生。随后对机制进行探究，作者发现，衣康酸盐能够和Nrf2结合蛋白KEAP1直接结合并且促进其C151发生烷基化从而来诱导Nrf2的表达，最后起到一个抑制炎症发生的效果。小结：LPS诱导衣康酸盐的产生，后者结合KEAP1... 阅828 转5 评0 公众公开 18-03-31 17:32 |
林教授课题组早年就发现除了在 Wnt 信号通路的经典作用，Axin 作为支架蛋白在 JNK 信号通路中也起到了多重作用 [2]。从 2013 年的 Cell Metab 文章开始 [6]，林教授课题组开始将 AXIN 的研究拓展到了 AMPK 信号通路，首次报道发现了 AXIN-AMPK-LKB1 复合物相互作用的现象，确立 AXIN 在 AMPK 通路中的作用。关键活性位点的点突变、激活剂、通路... 阅1219 转11 评0 公众公开 18-03-30 08:44 |
