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| 共 27 篇文章 |
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如何解读系统进化树。1、进化树单元。基于不同树型展示结果的差异，图2这种拓扑结构的进化树多用于差异较大的物种，而图3更适合做亲缘关系较近物种的进化树。cladogram：分支仅代表进化关系，不代表进化时间，TREE1 = TREE2.无根树(TREE2)：不能从树中找到物种的共同祖先，树中一个节点有三个分支，其余节点为两个分支。相对与梯状树(TREE1 &am... 阅1 转自萌小芊 公众公开 20-10-28 10:42 |
基于这三个基本元素，本地Blast运行方式即是用户选定目标序列(subject)并将其构建成数据库，然后用待比对序列(query)在数据库中搜索，待比对序列遍历数据库中的每一条目标序列后得到最终比对结果。blastx：核酸序列与蛋白库作比对，将核酸序列先翻译成蛋白序列，再将其与蛋白库作比对。-p:建库类型( F-核苷酸序列数据库，T-蛋白质序列数据库)，... 阅1051 转2 评0 公众公开 20-10-20 16:42 |
是一种定量分析技术，是指利用流式细胞仪检测细胞特异性标记荧光信号而测定细胞的多种生物物理性质的方法，同时也是一项可以把具有某相同荧光信号特性的某些细胞亚群从多细胞群体中分离和富集出来的细胞分析技术。如果其特性与要分选的细胞相同时，仪器就在这类细胞形成液滴时给该液滴充与指定的电荷，这样，当被选定的细胞形成液滴时就带有特... 阅103 转1 评0 公众公开 20-10-20 10:40 |
【科研】比较基因组学。比较基因组学是将不同物种的基因组相互比较，以了解物种间进化和分子差异的生物学领域。基因组测序和基因组比较。除了人类基因组，一些模型生物的基因组现在已经测序——包括黑猩猩、老鼠、果蝇、河豚鱼、蛔虫、面包酵母和细菌。比较基因组学的第一步是比较一般特征，如基因组大小、基因数量和染色体数量。比较基因组学... 阅310 转1 评0 公众公开 20-10-20 10:26 |
流式细胞分选的原理及特点有这一篇就够了。它能够根据每个细胞的光散射和荧光特征，将特定的细胞从细胞群体中分选出来。所以人们又常常将流式细胞仪称为荧光激活细胞分选仪（fluorescence-activated cell sorter, FACS），其实FACS并不是流式细胞仪的通称，它是BD公司的注册商标。1. 少量细胞分选时，流式细胞分选精确度高（99%以上），速度快... 阅2401 转12 评0 公众公开 20-10-20 10:18 |
6个样本共测定了2458个细胞，所以文章的第一个图Fig1A展示的是这些细胞的基因在不同病人中的表达情况，而根据Marker基因的表达情况研究团队排除了两类非恶性细胞（nonmalignant ）亚群（A图中的NM和B图中的Immune cell与Oligodendrocyte），接下来进一步从拷贝数变异和基因突变角度对“恶性细胞”基因水平的变异进行检测分析（WGS/WES），就是... 阅200 转1 评0 公众公开 20-10-19 21:04 |
snRNA-seq能够获得更为可靠和准确的结果，更加充分了解组织的细胞异质性和细胞的分化、发育状态经过近年来的大量数据积累，已经可以确定snRNA-seq能够解决scRNA-seq中存在的主要问题，具有以下几点突出的优势。snRNA-seq正在成为一种主流趋势近3年来，snRNA-seq文献增长趋势较为迅速，特别是国际主流实验室在进行单细胞转录组测序时，均倾向于... 阅161 转2 评0 公众公开 20-10-19 21:02 |
基因共表达网络图和蛋白互作网络图分不清楚？前面我们介绍了怎么对RNseq差异基因绘制个性化热图和共表达网络图，今天来教大家怎么利用差异基因绘制蛋白互作网络图。这里先介绍一下基因共表达网络图和基因蛋白互作网络图的区别。基因蛋白互作网络图是利用数据库中已经知道存在互作关系的基因对绘制网络图，目前主要使用STRING在线网站进行基因蛋... 阅3779 转6 评0 公众公开 20-10-19 15:57 |
基因共表达网络分析（Gene Co-expression Network Analysis）是基于基因间表达数据的相似性而构建的网络图，图中的节点代表基因，具有相似表达谱的基因被连接起来形成网络。共表达网络的建设从概念上来讲是简单直观的，通过基因表达的相似性可分析基因产物可能的相互作用关系，从而了解基因间相互作用脉络及寻找核心基因。在网络结果图中，可用... 阅1 转自石头6feix... 公众公开 20-10-19 15:47 |
EXCEL竟能如此简单地搞定基因共表达网络分析。基因与基因之间的关系千丝万缕，基因共表达网络（Gene co-expression network）是用来分析基因间作用关系的一种常用手段。此外，在预测非编码基因的靶基因时，除了各种靶基因预测工具，基因共表达网络分析也是一件利器。2、筛选差异基因，构建差异基因的表达矩阵；差异基因也没有筛选，只是随便选... 阅611 转2 评0 公众公开 20-10-19 15:46 |
