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10种DNA甲基化测序技术，你知道几个？5’羟甲基胞嘧啶(5’hmC)是5’甲基胞嘧啶脱甲基成胞嘧啶过程的中间产物，重亚硫酸盐测序无法对二者进行区分。5’甲基胞嘧啶和未甲基化的胞嘧啶被脱氨基成尿嘧啶，进而可以从单个碱基水平鉴定5’羟甲基胞嘧啶(5’hmC)。MeDIP是一种采用抗体或甲基化DNA结合蛋白来捕获富集甲基化DNA的技术，这种技术可以发现... 阅984 转4 评0 公众公开 18-07-14 22:03 |
如表2所示，我们有覆盖所有甲基化位点的WGBS技术，此外还有两种覆盖~10% 甲基化位点的“CpG Panel”，一种是基于探针杂交的捕获平台(简称：甲基化捕获)，比如Roche SeqCap Epi CpGiant Kit、Agilent SureSelect MethylSeq Kit，另一种CpG Panel是基于MspI酶切的RRBS（Reduced representation bisulfite sequencing，RRBS），它所覆盖的CpG位点... 阅1624 转32 评0 公众公开 18-07-14 22:02 |
肿瘤相关的甲基化高通量数据介绍。目前肿瘤甲基化数据主要来源于4种技术，包括基于测序的whole-genome bisulfite sequencing(WGBS)，methyl-binding domain capture sequencing(MBDCap-Seq)，reduced-representation-bisulfite-sequencing (RRBS)以及Infinium HumanMethylation450BeadChips (HM450, Illumina)，通常称为甲基化450k芯片，即能检... 阅917 转11 评0 公众公开 18-01-24 11:35 |
关键词：甲基化特异PCR、DNA甲基化、Methylation-specificPCR、甲基化特异PCR文献、甲基化特异PCR引物设计、甲基化特异PCR实验注意事项。MSP的引物设计与普通的PCR引物设计不同，MSP的引物设计原理是：模板DNA在经过亚硫酸盐处理后，发生甲基化的基因启动子区域CpG岛内CpG位点5 一端胞嘧啶保持不变；按MSP的要求，任意DNA序列在做MSP扩增时，至... 阅74 转1 评0 公众公开 17-11-14 19:29 |
