有人说,不同星座、不同属相的人在性格上的差异,是由DNA上的甲基化状态决定的;不管怎样,DNA的甲基化在生命的各个阶段具有着十分重要的作用。 那么,什么是DNA的甲基化呢? DNA甲基化是指针对DNA序列上的CpG岛,由甲基化转移酶将S腺苷甲硫氨酸的甲基转移给胞嘧啶。其中,5’甲基胞嘧啶(5mC) 的甲基化是一个非常重要的表观遗传学修饰事件,该事件能够调控基因活性,并影响着如细胞分化、转录调控和染色质重塑等生物学过程。 随着下一代测序技术(NGS)技术的发展,使我们能够从全基因组水平来分析5’甲基胞嘧啶及组蛋白修饰等事件,由此能够发现很多传统的基因组学研究所不能发现的东西,这就是所谓的“DNA甲基化测序”! DNA甲基化测序方法按原理可以分成三大类: 一、重亚硫酸盐测序; 二、基于限制性内切酶的测序; 三、靶向富集甲基化位点测序; 基于以上原理又有数种不同的测序方法,下面,有测序君向大家介绍十种DNA甲基化测序的常用方法及参考文献: 1) 重亚硫酸盐测序 该方法可以从单个碱基水平分析基因组中甲基化的胞嘧啶。首先,利用重烟硫酸盐对基因组DNA进行处理,将未发生甲基化的胞嘧啶脱氨基变成尿嘧啶。而发生了甲基化的胞嘧啶未发生脱氨基,因而,可以基于此将经重亚硫酸盐处理的和未处理的测序样本进行比较来发现甲基化的位点。
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