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掌握 FlowJo 核心功能,高分文章不是梦。大家都说 FlowJo 处理流式数据好用,大多数 TOP10 免疫学期刊上的文章都是用 FlowJo 分析数据。为了帮助大家尽快了解新版 FlowJo 的功能特性,更好地运用 FlowJo 处理实验数据,今天咱们谈谈 FlowJo 的四大核心功能!FlowJo 包含多种专相数据分析平台,使用者不用购买其他单独的分析软件,FlowJo 就可以...
感染风疹病毒后常有发热、头痛、咽痛、流涕等轻微前驱症状和枕骨下、耳后、颈部淋巴结肿大,约1~2天从面颈部开始出现淡红色斑疹、斑丘疹,24h内蔓延躯干、四肢,皮疹历时短、消失快,躯干部皮疹可融合,四肢皮疹散在不融合。上面3张图都是1岁以内患儿幼儿急疹的临床图片,与麻疹、风疹一样都是以红色斑丘疹为主要的皮疹,但疹子的颜色、密度都...
本文系统地分析了TCGA中491个LUAD和471个LUSC队列中的全基因组选择性剪接事件,发现了一些生存相关的选择性剪接事件。使用TCGA中LUAD和LUSC 的level 3的RNA-seq数据计算的基因表达水平,鉴定了在LUAD和LUSC中基因表达水平与OS显著相关的51和11个剪接因子。虽然本研究主要集中在非小细胞肺癌预后相关的选择性剪接事件,LUAD和LUSC癌症特异性和临...
符启林认为,首期公共维修基金确定为房地产开发企业和购房人共同承担比较合理,因为房地产开发企业对其售出的房屋的质量应当承担一定的责任,而缴纳前期公共维修基金即是一个重要的方面。对此,符启林认为,公共维修基金的收取人实际上是首期公共维修基金的代收者,购房者与公共维修基金的代收者之间是委托关系,从基金的安全及公平角度考虑,...
最后作者得到一个结论是大豆基因组中很多基因发生了AS事件,并且基因结构和转录水平的变化调控AS的发生。鉴定到来自3,774个细粒棘球绦虫基因的6,826个AS事件和来自多房棘球绦虫的3,611个基因的6,644个AS事件,表明在两种寄生虫中有33-36%的基因发生AS事件。在此文中作者在72%的表达基因中鉴定了来自菜豆的的85,570个AS事件和70%来自G.max的...
如何通过Google来使用ggplot2可视化。ggplot2绘图系统(ggplot2 Plotting System)这里, aes所提供的参数,就通过 ggplot提供,而不是提供给 geom_point,因为 ggplot里的参数,相当于全局变量, geom_point()和 stat_smooth()都知道x,y的映射,如果只提供给 geom_point(),则相当于是局部变量, geom_point知道这种映射,而 stat_smooth不知...
另外针对OMIM的收录条目的数字使用也有区别:(https://www.omim.org/help/faq#1_11 1.2 What numbering system is used in the OMIM database?)我们可以看到图示框中分别有基因位置、对应表型、表型的MIN编号、遗传特点、表型对应到基因型的基础情况、基因位置和基因/位点的MIM编号,另外我们将鼠标放到相应信息位置可以看到对该信息的简单解...
高颜值的在线绘图工具推荐。偶然看到一个还不错的在线绘图工具,这里推荐给大家,名字叫EasyChart(http://www.ehbio.com/ImageGP/index.php/Home/Index/index.html)目前网站只推出了三种类型的绘图:线图、GO聚类气泡图和热图,后续会有火山图、散点图、PCA、Venn图等工具可供使用。数据格式分两种,wide和long。下图中左为wide格式,右为long...
火山图。Venn图。这个图常见于测序或者芯片结果的一个展示,用于评估数据总体分布集中趋势,比如下面这张图(X轴为基因在对照组中的表达,Y轴为基因在实验组中的表达)下方的黑点表示该位置有数据,灰点表示没有,这些黑点灰点的排列组合构成了Samp的全部组合关系,连线表示Samp间存在交集,所以第一列数据的意思就是:Samp4,Samp2和Samp5之间...
当我们拿到基因表达的P值和倍数后,为了用火山图展示结果,一般需要把倍数进行Log2的转化,比如某基因在实验组表达水平是对照组的4倍,log2(4)=2,同样的如果是1/4,也就是0.25,转换后的结果就是-2。这样,我们就把虚线Y=1.30以上,X=1右侧和X=-1左侧的基因标记为表达显著差异的基因,一般我们把大于2倍(X=1右侧)的点标记为红色,把小于-2...
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