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KEGG数据库入门：pathway信息查询。今天就翠花就讲讲：在研究中如何使用KEGG数据库进行信号通路查询，这可是KEGG数据库的入门级知识哦！１.首先打开KEGG主页：http://www.kegg.jp/，点击下图框中的KEGG PATHWAY链接。这是KEGG里面整理出来的cell cycle相关信号通路图，细胞周期中S期的相关基因（我们上面举的例子是A沉默后可以把细胞阻滞在S期... 阅1 转自田明17gra... 公众公开 20-07-07 15:44 |
KEGG与GO注释与富集分析解析。 阅1 转自微笑如酒 公众公开 20-07-07 15:44 |
下面我们分析这张网络关系图存在主要问题，（1）Node参数设置过于单一，比如Node size没有参数意义，Node Color和Border Paint没有做参数设置，甚至Node Shape过于单调，显得整体效果过于简单，毫无凸显张力。比如这里，小编把FC值（中位值计算FC避免异常值干扰）作为Node size的参数，将Mapping Type设置成Continuous Mapping通过设置FC值和No... 阅1 转自李江硕 公众公开 20-07-07 09:18 |
Cytoscape史上最全攻略。导入网络数据这个和欢迎界面的一样，导入表格则是通过导入一个表格的信息对节点或者线注释（导入数据时建议导入txt格式的文件！）。2、这个表格是针对node还是edge，如果是只针对node那么无法用这个表格的数据对edge进行注释。调整节点颜色和相应的透明度，节点有Type注释的设置成白色，其它的为橙色。最后来讲一讲APPs... 阅1 转自石头6feix... 公众公开 20-07-07 09:12 |
Cytoscape史上最全攻略。导入网络数据这个和欢迎界面的一样，导入表格则是通过导入一个表格的信息对节点或者线注释（导入数据时建议导入txt格式的文件！）。2、这个表格是针对node还是edge，如果是只针对node那么无法用这个表格的数据对edge进行注释。调整节点颜色和相应的透明度，节点有Type注释的设置成白色，其它的为橙色。最后来讲一讲APPs... 阅1 转自心随所愿zh 公众公开 20-07-07 09:09 |
这些病毒帮我们抵抗疾病，甚至存在我们的基因组中。新城疫病毒（newcastle disease virus，NDV）、单纯疱疹病毒-1（herpes simplex virus-1，HSV-1）、呼肠孤病毒（reovirus）、溶瘤腺病毒（oncolytic adenovirus）等是由嗜肿瘤特性而被用来改造成溶瘤病毒，它特异性识别并感染肿瘤细胞，最终导致细胞溶胀而摧毁肿瘤细胞，但无法在正常机体细胞... 阅484 转2 评0 公众公开 20-06-27 22:20 |
[原]一文带你飞跃QPCR 荧光定量 PCR 中， PCR 反应体系中加入了荧光分子，通过荧光信号的变化来反应扩增产物的变化，使 PCR 产物的实时检测成为可能。起初由于PCR扩增产物呈双链,具有较高的荧光信号强度,随着温度的渐渐升高,DNA双链渐渐打开,嵌入DNA双链中的 SYBR Green I数量减少,荧光信号强度就渐渐降低,当双链DNA解链一半时,荧光信昼强度急剧下降,此时的温度即融... 阅1408 转42 评0 公众公开 20-06-17 23:04 |
[原]标签蛋白大盘点 分别是增强型绿色荧光蛋白/增强型黄绿色荧光蛋白/增强型黄绿色荧光蛋白/单体红色荧光蛋白,具有不同的激发波长发射波长为，均由野生型荧光蛋白通过氨基酸突变和密码子优化而来，更通俗的说法应该是报告基因。mCherry是从DsRed演化来的性能最好的一个单体红色荧光蛋白，可以和GFP系列荧光蛋白共用，实现多色标记体内、外实验表明，mCherry在N端和... 阅1119 转10 评0 公众公开 20-05-31 23:49 |
动物实验基因干扰的常用方法。体内实验进行基因干扰目前接触到的主要有两种形式：siRNA形式和shRNA病毒。shRNA病毒应用体内实验可能主要会有两种形式，一种是动物的成瘤实验，另一种是直接用病毒注射动物进行基因干扰实验。直接用病毒进行体内基因干扰实验，常用的三种病毒（慢病毒、腺病毒、腺相关病毒）都可以进行，受制于三种病毒各自的优缺... 阅361 转2 评0 公众公开 20-05-22 14:29 |
目前在细胞水平做基因干扰主要有三种方式：siRNA、shRNA质粒和shRNA病毒。shRNA质粒是以质粒的形式通过转染试剂或者电转将质粒转染细胞，质粒进入细胞后通过U6等相关的启动子启动sh的转录，转录为siRNA的形式发挥作用。shRNA病毒是将含有sh序列的质粒包装进入相应的病毒（常用的有慢病毒、腺病毒、腺相关病毒）中，用病毒感染目的细胞，病毒进... 阅241 转6 评0 公众公开 20-05-20 15:34 |
