| 共 19 篇文章 |
|
文献精读——精神分裂症中环状RNA表达谱分析（下）他们发现尽管只有半数的差异环状RNA的宿主基因体现出相同的变化趋势（如下图A)，但环状RNA表达下调与对应宿主基因的表达差异具有微弱的相关性（P=0.022，如下图A）。作者进一步研究表达差异的基因是否转录出表达差异的环状RNA，或者表达差异的环状RNA是否来自与表达差异的基因。套路大家懂的，... 阅75 转0 评0 公众公开 19-05-23 13:30 |
文献精读——精神分裂症中环状RNA表达谱分析（上）在total RNA建库数据集中，通过对17个病例和18个健康对照的大脑DLPFC脑区进行转录组差异分析鉴定得到574个差异环状RNA，其中68%的差异环状RNA表达下调（如图A,B）。DLPFC脑区转录出的环状RNA特点。分析环状RNA的宿主基因发现大多数基因只转录出一个环状RNA转录本。如下图，作者按照表达水平均... 阅83 转0 评0 公众公开 19-05-23 10:49 |
#从结局变量中取出工具变量所对应的效应值outcome_dat <- read_outcome_data( snps = bmi_exp_dat$SNP, filename = "gwas_summary.csv", sep = ",", snp_col = "rsid", beta_col = "effect", se_col = "SE", effect_allele_col = "a1", other_allele_... 阅3072 转24 评0 公众公开 19-05-23 09:45 |
Circ-Vav3作为gga-miR-375海绵能够促进上皮-间质转化。circ-Vav3 - gga-miRNA-375 - YAP1调控关系的验证。首先作者先验证circ-Vav3载体导入 gga-miRNA-375过表达的DF-1细胞中的表达情况 (Fig. 5A)，随后通过定量 (Fig. 5C, D) 及Western blotting (Fig. 5B)验证，结合前人研究结果参与EMT过程中YAP1蛋白水平上调，说明 circ-Vav3 能够作为 gga-... 阅55 转0 评0 公众公开 19-03-19 16:22 |
阿尔兹海默病，基因知多少？采用尸检大脑皮层组织的靶向基因分析表明许多风险基因的表达发生了变化，如：HLA-cluster, MS4A-cluster基因,FRMD4A, CLU, SORL1, ABCA7,PTK2B, BIN1, TREM2和CD33。基因共表达网络可以发现新的基因互作和网络关系，这种关系的发现并不依赖于基因的差异表达。在AD研究中，发现的相关基因有：起着调控免疫/小胶质细胞... 阅949 转6 评0 公众公开 19-01-14 15:36 |
1．收集PD相关的致病基因。最终，作者找到了242个基因与PD相关，称之为PD-related genes set ( PDgset )。然后，作者对PDgset中比较典型和特殊的基因进行简单的描述，以佐证PD相关基因集的多样性正好反映了PD疾病的复杂性（这是写文章的套路啊~~）。作者紧接着挑了几个基因（~~这个挑选基因肯定是挑选容易解释的基因噢~~），从文献证据证明其与... 阅138 转2 评0 公众公开 18-11-22 10:56 |
植物 circRNA 系列|文献阅读 4|拟南芥叶片发育过程中circRNA的鉴定。已有报道显示，植物circRNA与动物circRNA的特征存在诸多差异，植物circRNA的生物合成及功能研究尚不清晰，因此本文围绕叶片周期过程中circRNA为研究内容展开，并借以RT-PCR实验验证，旨在探索调控叶片生理过程的circRNA.circRNA的功能注释。通过差异表达筛选到一批在衰老过程... 阅93 转2 评0 公众公开 18-09-07 16:00 |
总结该文章的思路，首先通过高低饮食组证明MHFD小鼠的社交行为和肠道微生物发生了改变，然后通过Co-housing和FMT进一步证明是微生物的改变影响了社交行为的改变。另外肠道微生物检测发现，与MRD小鼠同笼之后的MHFD小鼠肠道微生物（下图橙色）变得与MRD小鼠更为接近。为了进一步何种机制影响了MHFD小鼠的社交行为，通过之前的文献报道得知催产素... 阅389 转2 评0 公众公开 18-08-09 17:30 |
题目为Loss of a mammalian circular RNA locus causes miRNAderegulation and affects brain function，文献分享将围绕Cdr1as展开，主要内容包括体内与Cdr1as互作的miRNA鉴定，Cdr1as的表达模式，KO小鼠模型的构建及干扰排除，敲除Cdr1as后对miRNA、靶基因及相关表型的影响，并解释为何在Cdr1as KO小鼠中，Cdr1as互作的miR-7下调而miR-671上调... 阅95 转5 评0 公众公开 18-08-03 11:22 |
目前已有多个实验预测且证实，circRNA作为一种内源性竞争RNA可以通过MREs竞争miRNAs，比如Cdr1as包含～70个保守的miR-7结合位点及一个miR-671结合位点。介于两者与Cdr1as序列互补方式的不同，miR-671能够触发Cdr1as的降解，间接影响miR-7的水平。其次对四个高水平表达Cdr1as脑区域进行miRNA测序，以比较KO小鼠与野生型间miR-7和miR-671表达水平... 阅550 转13 评0 公众公开 18-07-26 09:57 |
