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| 共 31 篇文章 |
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肿瘤免疫浸润分析工具汇总-数据挖掘新高度。基因表达与免疫浸润的关系，从转录组数据提取出免疫浸润数据。计算免疫浸润的软件工具从算法层面主要分为三类，包括基于Marker gene的算法，基于partial deconvolution，以及complete deconvolution。白介素2同学特地标记出来两个网页版的工具，亲测有效，墙裂推荐试试TIMER，简直可以说肿瘤免疫浸润... 阅40 转3 评0 公众公开 19-02-02 16:34 |
数据库专题之TCGA.更多阅读：https://cancergenome.nih.gov/abouttcga/aboutdata/platformdesign TCGA数据类型。虽然在TCGA中直接下载数据的方法较为繁琐，但是有多个网站提供TCGA数据（包括表达和临床等）完善的整理：GDAC， Cancer Browser和cBioportal是其中整理最为完整和可靠的。自2016年7月15日起，TCGA(The Cancer Genomic Atlas) DA... 阅120 转1 评0 公众公开 19-02-02 16:30 |
这个逆天的网站，专治英文SCI写作各种水土不服！小编今天隆重向大家安利一个神奇的网站——Academic Phrasebank，专治英文SCI写作的各种水土不服。Academic Phrasebank网站是由曼彻斯特大学的博士John Morley创办的，里面提供了大量的SCI写作句型和短语，参考材料都是来自于英语母语者的文章。3、神奇宝典万能句式模板。确实，在前期实验基础扎... 阅1101 转3 评0 公众公开 19-01-10 11:58 |
Meta分析异质性大？审稿人嫌弃异质性太高？让做meta回归？今天我们就来理一理，异质性/meta回归/发表偏倚/亚组分析/敏感性分析之间的关系。所以异质性是必然存在的，但要在合理的范围。Meta回归，看到底是哪个因素导致的异质性，当然了，如果影响因素很明显或者涉及因素很少的话，也没有必要做meta回归，直接做亚组分析就好了。而meta分析是基... 阅220 转0 评0 公众公开 18-10-15 00:23 |
首先，miRNA命名先确定物种名称，如人种的为hsa，然后加上miRNA的简写miR/mir，最后加上其被发现的顺序，如上述的hsa-miR-217。例如这个miR-17-92簇，它能产生miR-17、miR-18、miR-19a、miR-20、miR-19b、miR-92这6个成熟的miRNA。miRNA前体：以动物物种缩写-mir-命名顺序，如hsa-mir-227；miRNA成熟链：以动物物种缩写-miR-命名顺序，如hsa-mi... 阅57 转1 评0 公众公开 18-10-12 23:48 |
原来90%的人刷文献方式都错了！定课题之前的文献选择：对于一个以前没有接触的陌生领域看文献的方式是先看中文综述，然后是中文博士论文，而后是英文综述，最后是英文期刊文献。但它是你迅速了解你的研究领域的入口，在此之后，你再看外文文献会比一开始直接看外文文献理解的快得多。在归类时，重要文献可以根据重要程度在文件名前加001，002，... 阅178 转2 评0 公众公开 18-10-12 22:14 |
Endnote X9 最新正版授权免费下载及安装教程 [Win Mac]参考：http://www.howsci.com/endnote-installing-export-helper.html.不要慌，打开系统盘（一般为 C 盘）下面的 Program Files (x86) 文件夹，就可以找到 Endnote X9 文件夹了，其他版本的 Endnote 文件夹也在该目录下，不同版本的正版 Endnote 是可以共存的。进去找到 EndNote.exe 文件... 阅13875 转26 评2 公众公开 18-10-12 15:19 |
不做肿瘤研究，数据挖掘怎么发文章？文章思路：GEO中基因表达芯片数据组（GSE20680,87个CAD样本和52个正常样)(GSE20681 ,99 CAD样本和99正常样本）→CAD差异基因1208条→miR2Disease和miRTarBase预测CAD相关miRNA 5条→lncRNA Disease database预测了和CAD有关的lncRNA→预测CDKN2B-AS可能以ceRNA机制靶向GATA2, MAP1B和ARG1基因的表达→样本验... 阅16 转0 评0 公众公开 18-10-11 22:07 |
本文以科研的视角展开，具体从论文框架、语言技巧、作图风格、查重等多个方面论述如何将自己的辣鸡科研写成一篇优秀的毕业论文。本人曾在《Nature &Science》发表论文十余篇，接下来我将用我多年来积累的学术经验为大家仔细阐述如何进行论文框架的创新。这是学术界的一条铁律：学术成果是能力问题，但论文字数是态度问题，能力再差，态度都... 阅249 转0 评0 公众公开 18-10-08 15:31 |
GEO和TCGA数据库挖掘文章思路！首先，作者利用GEO数据库当中关于CRC的4个miRNA表达芯片数据，寻找患病样品和正常样品中差异表达的miRNA，通过取交集初步筛选到8个miRNA，再利用TCGA数据库中的CRC样本进行筛选，和qRT-PCR验证，其验证不仅在组织样中，同时还在血液中进行筛选，方便后续通过血液检测筛查CRC患者。最终确定了两个miRNA在CRC患者的... 阅43 转0 评0 公众公开 18-10-06 23:06 |
