miRNA的名字，到底是什么意思？

成熟的miRNA是一类内源性非编码单链RNA，其长度约为19-25nt，具有很高的保守性。其通过装载进入AGO2蛋白形成RISC复合物，对靶基因进行转录后调控作用，在生物进程中起到非常重要的作用。

1、miRNA相关数据库

miRBase是miRNA主要的公共数据库，提供miRNAs序列以及注释查询、定位、发卡序列查询，以及提供命名服务。

截止到现在，miRBase 21 共收录了28645条miRNA信息。其中人类的共收录了1881条pre-miRNA(前体)，以及2588条成熟的miRNAs。

2、miRNA的命名规则

一般情况，我们从文献上看到一条miRNA，它名称一般是这样的：miR-21、let-7等等。但很多的时候，我们看到的miRNAs是这样的：

rno-miR-9*

1. 首先，miRNA命名先确定物种名称，如人种的为hsa，然后加上miRNA的简写miR/mir，最后加上其被发现的顺序，如上述的hsa-miR-217。

2. 在确定命名规则之前发现的miRNA，则保留原来的名字，如hsa-let-7。

3. 有一类同源的miRNAs，它们可能只有1-2个碱基的差别，同源性非常高，那么在第一个发现并命名的miRNA后加上a、b、c……

   

4. 有的miRNA可以由不同染色体的DNA序列转录而成，为了表示来源不同，则在名字后面加上1、2、3……

   
   

5. 在miRNA成熟过程中，一直到装配进AGO2蛋白，miRNA都是双链的，这就有可能从3'或5'端臂产生最终成熟的miRNA。在以前，产生表达水平高的miRNA后面不加任何符号，而表达量低的则加上“*”，以示区分。如：

   

   现在基本都使用“-5p”“-3p”来区分miRNA是由哪条臂形成的。
   

6. 还有一种情况是这样的：miR-17-92。这表示的是基因簇，在miRNA成熟过程中能产生多条的miRNAs。例如这个miR-17-92簇，它能产生miR-17、miR-18、miR-19a、miR-20、miR-19b、miR-92这6个成熟的miRNA。
   

3、不同物种之间的miRNA前体和成熟体命名的差别

a. 动物：

miRNA前体：以动物物种缩写-mir-命名顺序，如hsa-mir-227；

miRNA成熟链：以动物物种缩写-miR-命名顺序，如hsa-miR-227-5p。

b. 植物：

miRNA前体：以植物物种缩写-MIR+命名顺序，如ath-MIR156a。注意：MIR是大写，并与命名顺序之间没有“-”；

miRNA成熟链：以植物物种缩写-miR+命名顺序，如ath-miR156a-5p。注意：miR是小写，并与命名顺序之间没有“-”。

c. 病毒：与动物一致。

miRNA前体：以病毒物种缩写-mir+命名顺序，如bhv1-mir-B6；

miRNA成熟链：以病毒物种缩写-miR+命名顺序，如bhv1-miR-B6-5p。