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ceRNA是近几年来备受学术界关注的对象,它代表了一种全新的基因表达调控模式,相比miRNA调控网络,ceRNA调控网络更为精细和复杂,涉及更多的RNA分子,包括mRNA、编码基因的假基因、长链非编码RNA和miRNA等,它为科研工作者提供一个全新的视角进行转录组研究,有助于更全面、深入地解释一些生物学现象。2、ceRNA都受miRNA调控。ceRNA是除miRNA调...
CircRNA研究永不消退的热点——ceRNA机制。circWAC通过miR-142/WWP1/PI3K/AKT信号机制促进TNBC的发生发展和PTX的化疗耐药性。基于GEO数据集鉴定Tnbc相关circRNA,采用RT-PCR检测circWAC在TNBC细胞和组织中的表达水平,然后进行体外和体内功能实验,评价circWAC对TNBC的作用。总之,CircWAC / miR-142 / WWP1形成竞争性内源RNA(ceRNA)网络,以调...
完整的ceRNA机制研究应包含这些内容1. 简介随着ceRNA机制研究的套路化,ceRNA研究越来越难发高分文章,但这并不表示单纯的ceRNA研究已经落伍了,小编发现5月份发表的几篇关于circRNA作为ceRNA的高分研究都是遵循ceRNA研究套路的,为什么能发高分,主要还是实验够量,从多角度多层次分析ceRNA调控机制。(4)ceRNA调控分析为了探讨circCCDC9、mi...
而实际调控过程中不仅仅是简单的microRNA-mRNA的沉默机制,还有更为复杂的调控网络,一些非编码的RNA同样存在与microRNA的结合位点,在细胞中起到miRNA海绵(miRNA sponge)的作用,进而解除miRNA对其靶基因的抑制作用,升高靶基因的表达水平,也因此构建了庞大的ceRNA网络(ceRNETs),这一作用机制被称为竞争性内源RNA(ceRNA)机制。方法概...
2)已知miRNA可以通过结合mRNA导致基因沉默,而ceRNA可以通过竞争性地结合miRNA来调节基因表达。3)ceRNA可以通过应答元件(miRNA response elements,MREs)与miRNA结合从而影响miRNA导致的基因沉默。五、ceRNA经典案例—ceRNA与胃癌。宁波大学医学院的研究人员,针对胃癌中长链非编码RNA(lncRNAs)相关的竞争性内源RNA(competing endogenous R...
ceRNA(competing endogenous RNAs,竞争性内源RNA)假说是指一种全新的基因表达调控模式,我们已知miRNA可以通过结合mRNA导致基因沉默,而ceRNA(lncRNA、circRNA...)可以通过竞争性结合miRNA来调节基因表达,从而影响细胞的功能。SBC ceRNA芯片。SBC ceRNA芯片是?circRNA、lncRNA作为竞争性内源RNA(ceRNA),竞争性结合miRNA,从而调控miRNA...
案例解析ceRNA研究思路 – GCBI学院。ceRNA具有miRNA结合位点, 能够竞争性结合miRNA, 抑制miRNA对靶基因的调控。作者通过系列实验和分析表明lncRNA可以在胃癌形成中作为ceRNA起作用,并验证了ceRNA网络关系中FER1L4-miR-106a-5p-RB1的作用关系。更普适的ceRNA研究思路如下所示,当获得差异表达当获得差异表达的mRNA、miRNA、lncRNA或circRNA...
也就是利用Luciferase的3''''''''''''''''UTR结合miRNA,来验证一下lncRNA和mRNA是不是分别能和miRNA结合。用于ceRNA研究的最常用的方法还有MS2-RIP,就是体外过表达LncRNA的时候,在末端接上一个MS2蛋白结合的串联序列,然后用MS2蛋白用RNA免疫共沉淀(RIP)的方法拉下来。当...
竞争性内源RNA(competing endogenous RNAs,ceRNA):mRNA、假基因转录物和长链非编码RNA等转录物通过microRNA应答元件竞争结合相同的microRNA来调控各自的表达水平,从而影响细胞的功能。即:microRNA通过结合靶基因转录本调低RNA丰度。反之,不同的RNA分子通过竞争共同有限microRNA,彼此协同正向调控。l Versican3'''''...
A:目前ceRNA主要囊括的RNA包括mRNA, lncRNA, circRNA和miRNA,那么只需要构建两个文库:一个是通过去核糖体方式构建的文库,里面可以同时包含mRNA,lncRNA和circRNA信息,再构建一个miRNA文库,即总共两个文库就可以全方位系统解决ceRNA研究需求。A:并非如此,ceRNA调控机制作为普遍存在的现象,但是并非任何mRNA,lncRNA,circRNA都能够具有...
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