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CircRNA研究永不消退的热点——ceRNA机制

 小梦想在努力 2021-08-16

环状RNA一直是非编码RNA研究领域的宠儿,在不同的研究方向都有发现circRNA的新功能,吸引了无数研究者的目光,仅今年上半年(截至6月底)从pubmed中检索已发布的circRNA相关研究就达1783篇,其中ceRNA机制研究占了三分之一。CeRNA机制是否还能发高分的文章一直是大家关注的,今天就与各位老师分享最近发表的两篇高分文章,都是很经典的研究套路,值得借鉴。

01

circRHOBTB3通过调节HuR介导的PTBP1的mRNA稳定性在来抑制结直肠癌转移

标题Circular RNA circRHOBTB3 represses metastasis by regulating the HuR-mediated mRNA stability of PTBP1 in colorectal cancer

期刊:Theranostics.

影响因子:8.579

作者单位:浙江大学邵逸夫医院

摘要:结直肠癌(CRC)的肿瘤转移是大多数患者死亡的主要原因,也是CRC综合治疗的主要难点。环状RNA(circRNA)影响实体瘤中的许多生物学功能。然而它们在CRC转移中的机制仍不清楚。通过RNA测序(RNA-seq)和实时定量PCR筛选CRC组织和邻近正常组织之间差异表达的circRNA。进行CCK-8细胞迁移和划痕愈合试验以确定circRHOBTB3在细胞增殖和转移中的功能。RNA pulldown和RNA免疫沉淀试验验证circRHOBTB3和HuR(ELAVL1)蛋白之间的相互作用。进一步的 RNA-seq 和rescue experiments寻找下游靶标。进行小鼠异种移植模型,以阐明 circRHOBTB3 对体内癌症转移的影响。作者鉴定了在 CRC 组织和细胞系中显著下调的circRHOBTB3,并发现较低的circRHOBTB3水平与晚期临床分期和更大的转移风险显著相关。circRHOBTB3的过表达抑制了CRC肿瘤细胞的转移。从机制上讲,circRHOBTB3与HuR结合HuR是CRC发展中普遍表达的功能性RNA结合蛋白 (RBP),并促进β-Trcp1介导的HuR泛素化。通常HuR与靶标 mRNA 的 3'UTR 结合以增进其稳定性,而circRHOBTB3和HuR之间的相互作用会降解HuR以降低下游靶标PTBP1的表达。此外,在体内过表达circRHOBTB3可抑制肺转移,并且这种效果可以被PTBP1过表达部分逆转。在CRC细胞中,FUS和ADARB2均可促进circRHOBTB3的转录。研究结果表明,circRHOBTB3通过HuR/PTBP1轴对CRC侵袭性产生抑制作用。

02

circWAC通过miR-142/WWP1/PI3K/AKT信号机制促进TNBC的发生发展和PTX的化疗耐药性

标题:CircWAC induces chemotherapeutic resistance in triple-negative breast cancer by targeting miR-142, upregulating WWP1 and activating the PI3K/AKT pathway

期刊:Molecular Cancer.

影响因子:15.302

作者单位:苏州大学

摘要:化疗耐药是三阴性乳腺癌(TNBC)临床治疗失败和预后不良的主要原因。乳腺癌相关circRNA的研究尚处于起步阶段,尚未报道与TNBC中的化学敏感性相关的circRNA。基于GEO数据集鉴定Tnbc相关circRNA,采用RT-PCR检测circWAC在TNBC细胞和组织中的表达水平,然后进行体外和体内功能实验,评价circWAC对TNBC的作用。研究发现CircWAC在TNBC中高表达,并与更差的TNBC患者预后相关。随后,证实了circWAC的下调可以在体外和体内增加TNBC细胞对紫杉醇(PTX)的敏感性。TNBC中miR-142的表达与circWAC负相关。RNA免疫沉淀测定,荧光素酶报告基因测定,RNA pulldown和荧光原位杂交证实了TNW细胞中circWAC和miR-142之间的相互作用。从机制上讲,circWAC充当miR-142的“海绵”,以减轻miR-142对WWP1的抑制作用。此外,miR-142高表达的TNBC患者的总体生存率明显好于miR-142低表达的TNBC患者,这些结果在公共数据库中得到了验证。MiR-142调节WWP1的表达和PI3K / AKT途径的活性。证实了WWP1在TNBC中高表达,并且WWP1高表达的患者的预后较差。总之,CircWAC / miR-142 / WWP1形成竞争性内源RNA(ceRNA)网络,以调节TNBC细胞中的PI3K / AKT信号传导活性并影响细胞的化学敏感性。

Shbio human ceRNA array覆盖circRNA、lncRNA、mRNA。一份芯片数据同时提供三个层面的表达信息,circRNA和lncRNA作为典型的内源竞争性RNA(ceRNA机制),此款芯片可以让您畅游ceRNA调控研究。对circRNA检测特异性高:circRNA -特异的反向剪接位点探针设计,保证每个探针检测的特异性,避免与母基因之间的冗余影响。

Shbio human ceRNA array v3.0(规格:8 X 160K)芯片参数



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源于科技
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